ソーシャルエピゲノミクス。口腔保健のための概念化と考察

Social Epigenomics: Conceptualizations and Considerations for Oral Health.

抄録

ハイスループット技術の進歩と、ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム、メタボロームなどのマルチオミクスデータの生成は、口腔疾患の生物学的リスク層別化と予測への道を開いている。電子カルテ、調査、国勢調査、疫学データなどと統合することで、マルチオミクスはデータ駆動型の精密口腔保健、すなわち適切な個人/集団に適切なタイミングで適切な口腔保健介入を提供することを促進すると期待されています。一方、マルチオミクスは、ライフコースに沿って累積的に、受胎以降の様々な時点（以下、「ライフコース」ともいう）で、多数の社会的曝露によって変化する可能性がある。 例えば、不安定な社会・生活環境、関連する心理社会的ストレスなどの有害曝露は、エピジェネティック機構によって特定の遺伝子のスイッチを「オン／オフ」することに関連している。そして、これらの遺伝子は、異なる年齢層や集団における様々な健康状態に関連している。この論文では、精密口腔保健アプリケーションのための生物学的プロファイリングにおいて、社会的エクスポゾームの影響を考慮することは、生物学的リスクの定義が社会的リスクを上回らないようにするために必要であると論じている。マルチオミクス口腔保健研究およびその後の介入における社会的・外的要因の取り込みを促進するために、3つの関連する側面について議論する。まず、口腔保健のエピジェネティックな景観の要約を提示する。次に、非歯科系の文献から得られた知見をもとに、社会的エクスポゾームと遺伝子発現を結びつける経路やメカニズム（エピジェネティクスによる社会的経験の生物学的埋め込み）を詳しく説明する。次に、社会的エピゲノミクスを口腔保健研究に導入するための方法論的考察を、研究デザインと解釈への影響に重点を置きながら紹介する。最後に、ライフコースの口腔疫学研究に社会的エピゲノミクスを応用することで、現在および将来的な可能性について明らかにする。

Advances in high-throughput technologies and the generation of multiomics, such as genomic, epigenomic, transcriptomic, and metabolomic data, are paving the way for the biological risk stratification and prediction of oral diseases. When integrated with electronic health records, survey, census, and/or epidemiologic data, multiomics are anticipated to facilitate data-driven precision oral health, or the delivery of the right oral health intervention to the right individuals/populations at the right time. Meanwhile, multiomics may be modified by a multitude of social exposures, cumulatively along the life course and at various time points from conception onward, also referred to as the . For example, adverse exposures, such as precarious social and living conditions and related psychosocial stress among others, have been linked to specific genes being switched "on and off" through epigenetic mechanisms. These in turn are associated with various health conditions in different age groups and populations. This article argues that considering the impact of the socio-exposome in the biological profiling for precision oral health applications is necessary to ensure that definitions of biological risk do not override social ones. To facilitate the uptake of the socio-exposome in multiomics oral health studies and subsequent interventions, 3 pertinent facets are discussed. First, a summary of the epigenetic landscape of oral health is presented. Next, findings from the nondental literature are drawn on to elaborate the pathways and mechanisms that link the socio-exposome with gene expression-or the biological embedding of social experiences through epigenetics. Then, methodological considerations for implementing social epigenomics into oral health research are highlighted, with emphasis on the implications for study design and interpretation. The article concludes by shedding light on some of the current and prospective opportunities for social epigenomics research applied to the study of life course oral epidemiology.