遺伝的に老化しないハダカデバネズミのエピジェネティック老化

Epigenetic aging of the demographically non-aging naked mole-rat.

抄録

ハダカデバネズミ（NMR）は例外的に長寿のげっ歯類であり、加齢による死亡率の増加が見られないことから、人口統計学的に非加齢哺乳類と定義されている。ここでは、100匹以上のNMRの血液のバイサルファイト配列決定を行い、300万以上の共通CpG部位を評価した。メチル化が年齢と相関する部位に基づく教師なしクラスタリングにより、加齢に関連したメチロームのリモデリングが明らかになり、メチロームの情報損失も観察された。我々は、NMRの年齢を正確に予測するエピジェネティック老化時計を開発した。その結果、NMRの老化はマウスよりも遅く、ヒトよりも速いことがわかった。興味深いことに、TertとPrpf19における時計部位の加齢に伴う変化のパターンは、NMRとマウスで異なるが、2つの種間で保存されている部位もある。これらのデータを総合すると、NMRは他の哺乳類と同様に、この種の人口統計学的老化がない場合でも、エピジェネティックに老化することが示された。

The naked mole-rat (NMR) is an exceptionally long-lived rodent that shows no increase of mortality with age, defining it as a demographically non-aging mammal. Here, we perform bisulfite sequencing of the blood of > 100 NMRs, assessing > 3 million common CpG sites. Unsupervised clustering based on sites whose methylation correlates with age reveals an age-related methylome remodeling, and we also observe a methylome information loss, suggesting that NMRs age. We develop an epigenetic aging clock that accurately predicts the NMR age. We show that these animals age much slower than mice and much faster than humans, consistent with their known maximum lifespans. Interestingly, patterns of age-related changes of clock sites in Tert and Prpf19 differ between NMRs and mice, but there are also sites conserved between the two species. Together, the data indicate that NMRs, like other mammals, epigenetically age even in the absence of demographic aging of this species.