1958年に南アフリカのNdumuから分離されたKedougou virus (KEDV)が、アフリカにおけるKEDVの地理的・時間的範囲を拡大する

A 1958 Isolate of Kedougou Virus (KEDV) from Ndumu, South Africa, Expands the Geographic and Temporal Range of KEDV in Africa.

抄録

1972年にセネガルで初めて分離された蚊媒介性フラビウイルスであるKedougouウイルス（KEDV）は、デング熱、ジカ熱（ZIKV）、スポンドウェニ・ウイルス（SPOV）と遺伝的に関連しています。セネガルでの血清学的な調査や、中央アフリカ共和国でのKEDVの分離から、ヒトにおけるKEDVの感染の発生が示唆されているが、現在までに病気の報告はない。本研究では、南アフリカ共和国のクワズールー・ナタール州ンドゥムで採取された蚊から分離された1958年のKEDVのコード完全なゲノムを構築した。このAR1071 Ndumu KEDVは、プロトタイプのDakAar-D1470株とヌクレオチドで80.51％、アミノ酸で93.34％の一致を示し、吸血マウスへの脳内接種とVeroE6細胞での継代によりSPOVと共分離された。この歴史的な分離株は、この比較的未知のフラビウイルスの地理的・時間的な範囲を拡大するものであり、今後の系統的な校正や診断法の改良に役立つものである。

The mosquito-borne flavivirus, Kedougou virus (KEDV), first isolated in Senegal in 1972, is genetically related to dengue, Zika (ZIKV) and Spondweni viruses (SPOV). Serological surveillance studies in Senegal and isolation of KEDV in the Central African Republic indicate occurrence of KEDV infections in humans, but to date, no disease has been reported. Here, we assembled the coding-complete genome of a 1958 isolate of KEDV from a pool of mosquitoes collected in Ndumu, KwaZulu-Natal, South Africa. The AR1071 Ndumu KEDV isolate bears 80.51% pairwise nucleotide identity and 93.34% amino acid identity with the prototype DakAar-D1470 strain and was co-isolated with SPOV through intracerebral inoculation of suckling mice and passage on VeroE6 cells. This historical isolate expands the known geographic and temporal range of this relatively unknown flavivirus, aiding future temporal phylogenetic calibration and diagnostic assay refinement.