S9.6 抗体を用いた DNA:RNA ハイブリッドの免疫沈降

Immunoprecipitation of DNA:RNA Hybrids Using the S9.6 Antibody.

• Hunter R Gibbons
• Thomas M Aune

抄録

DNA:RNAハイブリッドやR-ループの形成は、多くの生物学的プロセスに寄与しています。S9.6抗体の開発により、免疫沈降法によるR-ループ（DNA:RNAハイブリッド）の解析が可能になりました。ここでは、S9.6抗体を用いたDNA:RNAハイブリッド構造の単離について述べる。このプロトコールを用いて、R-ループのDNAとRNAの結合相手の両方をqPCR、全ゲノムシークエンシングなどの方法で解析することができます。

Formation of DNA:RNA hybrids or R-loops contributes to numerous biologic processes. The development of the S9.6 antibody makes the analysis of R-Loops (DNA:RNA hybrids) possible through immunoprecipitation. Here, we describe the isolation of DNA:RNA hybrid structures using the S9.6 antibody. Using this protocol, both the DNA and RNA binding partners of the R-loop can be analyzed via qPCR, whole genome sequencing, or other methods.