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台湾の症例対照集団における川崎病のゲノムワイド関連バリアントの検証
Validation of genome-wide associated variants for Kawasaki disease in a Taiwanese case-control sample.
PMID: 32678208 DOI: 10.1038/s41598-020-68673-0.
抄録
川崎病（KD）は、乳幼児が罹患する原因不明の急性熱性全身性血管炎である。川崎病の感受性には遺伝的基盤があるという仮説を支持するかなりの証拠がある。ゲノムワイド関連研究（GWAS）により、KDに関連するいくつかの遺伝的変異が同定されている。本研究では、日本人のGWASで同定された3つの新規なKD関連一塩基多型（SNP）を台湾の集団で再現することを目的としている。これらのSNPと冠動脈病変（CALs）の発症との関連も調査した。冠動脈病変患者681人と民族的にマッチした健常対照者563人を対象に、TaqMan AssayまたはDNAシークエンシングを用いて、rs2254546 A/G、rs2857151 A/G、およびrs4813003 C/T SNPをジェノタイピングした。その結果、rs2254546およびrs4813003 SNPsはKDと有意に関連していた（G対立遺伝子、オッズ比[OR]=1.54、P=1.0×10；C対立遺伝子、OR=1.32、P=8.1×10）。しかし、CAL発症との関連を示す証拠は観察されなかった。我々の研究は、台湾の集団において、rs2254546およびrs4813003 SNPsとKDとの関連を検証することに成功した。KDの病態を理解するためには、これらのSNPのさらなる機能研究が重要である。
Kawasaki disease (KD) is an acute febrile systemic vasculitis of unknown etiology that affects infants and young children. Considerable evidence supports the hypothesis that there is a genetic basis for KD susceptibility. Genome-wide association studies (GWAS) have identified several genetic variants associated with KD. This study aims to replicate three novel KD-associated single nucleotide polymorphisms (SNPs), identified by GWAS in Japanese, in a Taiwanese population. Associations between these SNPs and development of coronary artery lesions (CALs) were also investigated. The rs2254546 A/G, rs2857151 A/G, and rs4813003 C/T SNPs were genotyped in 681 children with KD and 563 ethnically-matched healthy controls using TaqMan Assay or DNA sequencing. We found rs2254546 and rs4813003 SNPs were significantly associated with KD (G allele, odds ratio [OR] = 1.54, P = 1.0 × 10; C allele, OR = 1.32, P = 8.1 × 10). However, no evidence for associations with CAL development was observed. Our study successfully validates associations of the rs2254546 and rs4813003 SNPs with KD in a Taiwanese population. Further functional studies of the SNPs are important in understanding the pathogenesis of KD.