潜在的な治療薬として特異的な新規広宿主範囲バクテリオファージDLP3の特性評価

Characterization of Novel Broad-Host-Range Bacteriophage DLP3 Specific to as a Potential Therapeutic Agent.

• Danielle L Peters
• Jaclyn G McCutcheon
• Jonathan J Dennis

抄録

細菌種に特異的な新規ファージが原始的な土壌サンプルから分離され、新たに確立された細菌属の第二のメンバーとして特徴付けられた。ファージDLP3は、これまでに特徴づけられたファージの中で最も広い宿主範囲を持ち、29株中22株に感染した。DLP3 のゲノムサイズは 96,852 bp で、G+C 含有率は 58.4% で、これは宿主株 D1571（G+C 含有率 66.9%）よりもかなり低い値です。DLP3ゲノムは、特異性の異なる5つのtRNA遺伝子を含むゲノムの95％をカバーする153のコード化ドメイン配列をコードしている。ＤＬＰ３ライソゲンは、野生型株と比較して、指数関数的な成長段階での成長速度の増加を示す。また、DLP3は機能的なエリスロマイシン耐性タンパク質をコードしており、宿主D1571株のライソゲン転換を引き起こしている。温帯性ファージではありますが、DLP3 は幅広い宿主範囲を示し、IV 型ピルスを介して宿主細胞に感染し、溶解活性を示すため、優れた治療の可能性を示しています。そのような温帯性のライフサイクルなどの望ましくない形質は、細菌感染症の治療に有用な修飾ファージを生成するために遺伝子技術を使用して排除することができます。

A novel phage specific to the bacterial species was isolated from a pristine soil sample and characterized as a second member of the newly established genus. Phage DLP3 possesses one of the broadest host ranges of any phage yet characterized, infecting 22 of 29 strains. DLP3 has a genome size of 96,852 bp and a G+C content of 58.4%, which is significantly lower than host strain D1571 (G+C content of 66.9%). The DLP3 genome encodes 153 coding domain sequences covering 95% of the genome, including five tRNA genes with different specificities. The DLP3 lysogen exhibits a growth rate increase during the exponential phase of growth as compared to the wild type strain. DLP3 also encodes a functional erythromycin resistance protein, causing lysogenic conversion of the host D1571 strain. Although a temperate phage, DLP3 demonstrates excellent therapeutic potential because it exhibits a broad host range, infects host cells through the type IV pilus, and exhibits lytic activity . Undesirable traits, such as its temperate lifecycle, can be eliminated using genetic techniques to produce a modified phage useful in the treatment of bacterial infections.

Copyright © 2020 Peters, McCutcheon and Dennis.