ヘリコバクター・ピロリ菌のコロニー化に重要なコレステリル-α-グルコシド転移酵素の阻害剤を設計した

Design of an inhibitor of Helicobacter pylori cholesteryl-α-glucoside transferase critical for bacterial colonization.

• Soumiya Pal
• Nishat Sarker
• Majjid Qaria
• Kshitij Tandon
• Yusuf Akhter
• Niyaz Ahmed

抄録

背景:

胃がんの原因菌であるヘリコバクター・ピロリの宿主として、世界人口の50％が消化管の胃部をコロニー化しています。ピロリ菌は、活性化された宿主免疫反応にもかかわらず、生涯にわたって宿主胃に感染するという驚異的な能力を持っています。

BACKGROUND: Fifty percent of the world's population surves as a host for Helicobacter pylori, gastric cancer causing bacteria, that colonizes the gastric region of digestive tract. It has a remarkable capacity to infect the host stomach for the entire lifetime despite an activated host immune response.

方法:

本研究では、ヘリコバクター・ピロリ（CapJまたはHP0421）のグリコシルトランスフェラーゼ酵素と、既知の基質結合ポケット内の対応する阻害剤ライブラリーとの間のタンパク質阻害剤結合の仮想スクリーニング解析を行った。我々は、コレステロール骨格からなるリガンドのライブラリーをCapJタンパク質とドッキングさせ、タンパク質の活性部位ポケットに存在するいくつかのリガンドの相互作用アミノ酸残基を同定した。

METHODS: In this study, we have performed the virtual screening analysis of protein-inhibitor binding between the glycosyl transferase enzymes of Helicobacter pylori (CapJ or HP0421) and a corresponding library of inhibitors in the known substrate-binding pockets. We have docked our library of ligands consisting of cholesterol backbone with CapJ protein and identified several ligands' interacting amino acid residues present in active site pocket(s) of the protein.

結果:

ほとんどの場合、リガンドは酵素の同じポケットと相互作用していた。酵素-基質反応の強力な阻害剤として作用する可能性のある上位3つのヒット（03）は、データセット全体からフィルタリングされた。

RESULTS: In most of the cases, the ligands showed an interaction with the of the same pocket of the enzyme. Top three (03) hits were filtered out from the whole data set, which might act as potent inhibitors of the enzyme-substrate reaction.

結論:

本研究は、H. pylori.のコロニー化を制限することができる新たな可能性について述べたものである。報告されたエビデンスは、これらの阻害剤をリード分子として開発するためには、包括的な知識と湿式実験室での検証が必要であることを示唆している。

CONCLUSIONS: This study describes a new possibility by which colonization of H. pylori. can be limited. The reported evidence suggests that comprehensive knowledge and wet laboratory validation of these inhibitors are needed in order to develop them as lead molecules.

© 2020 John Wiley & Sons Ltd.