胃癌におけるCLDN18の発現と遺伝子変化の解析

Analysis of the expression and genetic alteration of CLDN18 in gastric cancer.

• Jian Li
• Yao Zhang
• Dengmin Hu
• Tuping Gong
• Run Xu
• Jun Gao

抄録

クラウディン18（CLDN18）は、膜貫通型タンパク質であり、先端部に局在してタイトジャンクション複合体を形成する。胃癌（GC）での異常発現が報告されている。本研究では、The Cancer Genome Atlas (TCGA)、Gene Expression Omnibus (GEO)、Human Protein Atlas (HPA)データベースの公開データを用いて、複数のオンラインツールを用いて、CLDN18の発現、遺伝子変化、予後の役割を解析しました。GeneMANIAを用いて生物学的ネットワークを決定した。遺伝子発現は正常組織では肺と胃に限定され、GCでは有意に発現が低下していたが、他のいくつかのがん種では異所的に過剰発現していた。GCのmRNA発現と臨床病理との間には相関関係はなかったが、エプスタインバーウイルス（EBV）陽性のサブグループでは他のサブグループに比べて発現が高かった。GCでは遺伝子変異は一般的なものではなく、主な変異はエプスタインバーウイルス（EBV）との遺伝子融合であり、エプスタインバーウイルスの発現はGC患者の全生存期間（OS）を予測するものではなかった。本研究では、GCにおける遺伝子発現の特徴をまとめ、GCのバイオマーカーや治療ターゲットとしての可能性を示唆している。

Claudin 18 (CLDN18) is a transmembrane protein that localizes to apical regions to form tight junction complexes. Abnormal expression of has been reported in gastric cancer (GC). The expression, genetic alterations, and prognostic role of were analyzed using public data from The Cancer Genome Atlas (TCGA), Gene Expression Omnibus (GEO), and Human Protein Atlas (HPA) databases using multiple online tools. The biological network of was determined using GeneMANIA. Expression of was restricted to lung and stomach in normal tissues, was significantly downregulated in GC, but was ectopically overexpressed in some other cancer types. There was no correlation between mRNA expression of and the clinicopathology of GC, although expression was higher in the Epstein-Barr virus (EBV)-positive subgroup than other subgroups. Genetic alteration of was not a common event in GC; the main alteration was gene fusion with . expression did not predict the overall survival (OS) of GC patients. This study summarizes the expression features of in GC and suggests it may serve as a biomarker and therapy target for GC.