sp. nov.およびsp. nov.を土壌から分離した

sp. nov. and sp. nov., isolated from soil.

• Ye Lin Seo
• Shehzad Abid Khan
• Hyung Min Kim
• Byung Hee Chun
• Dong Min Han
• Che Ok Jeon

抄録

韓国の土壌から，グラム染色陰性の好気性嫌気性非可溶性細菌R11株とS1162株を分離した．両菌株ともカタラーゼおよびオキシダーゼ陽性であり，主要なイソプレノイドキノンとしてメナキノン-7を含有していた。菌株R11は、主要脂肪酸として和文特徴3（C ω7および/またはC ω6）、iso-C、Cおよびiso-C 3-OHを、主要極性脂質としてホスファチジルエタノールアミン、未同定アミノリン脂質および未同定アミノリン脂質を含有していた。一方、株Ｓ１１６２は、主要な極性脂質として、主要な脂肪酸、ホスファチジルエタノールアミンおよび未同定アミノリン脂質として、合計特徴量３（Ｃ ω７および／またはＣ ω６）、ｉｓｏ-Ｃ、ｉｓｏ-Ｃ ３-ＯＨ、Ｃおよび合計特徴量９（１０-メチルＣおよび／またはｉｓｏ-Ｃ ω９）を含有していた。全ゲノムから計算した株R11およびS1162のDNA G+C含量はそれぞれ42.7mol%および42.9mol%であった。16S rRNA遺伝子配列に基づく系統解析の結果、R11株はYC7004株と系統を形成し、S1162株は同属内の近縁種とは異なる系統を形成していることが判明した。R11株はYC7004株に，S1162株はBXN5-31株に，それぞれ97.78％，97.23％の16S rRNA遺伝子配列の類似度で最も近縁であった。表現型，化学運動学的および分子生物学的解析から，R11株およびS1162株は本属の新種であり，それぞれsp.の型株はそれぞれR11（=KACC 21228=JCM 33472）およびS1162（=KACC 21669=JCM 33916）である。

Two Gram-stain-negative, facultative anaerobic and non-motile bacteria, strains R11 and S1162, were isolated from soil in the Republic of Korea. Both strains were catalase- and oxidase-positive and contained menaquinone-7 as the major isoprenoid quinone. Strain R11 contained summed feature 3 (C ω7 and/or C ω6), iso-C, C and iso-C 3-OH as major fatty acids and phosphatidylethanolamine, an unidentified aminophospholipid and an unidentified aminolipid as major polar lipids; while strain S1162 contained summed feature 3 (C ω7 and/or C ω6), iso-C, iso-C 3-OH, C and summed feature 9 (10-methyl C and/or iso-C ω9) as major fatty acids and phosphatidylethanolamine and an unidentified aminophospholipid as major polar lipids. The DNA G+C contents of strains R11 and S1162 calculated from their whole genomes were 42.7 and 42.9 mol%, respectively. Results of phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences showed that strain R11 formed a phylogenetic lineage with YC7004 and strain S1162 formed a distinct phyletic lineage from closely related type strains within the genus . Strains R11 and S1162 were most closely related to YC7004 and BXN5-31 with 97.78 and 97.23% 16S rRNA gene sequence similarities, respectively. On the basis of phenotypic, chemotaxonomic and molecular analysis, strains R11 and S1162 represent two novel species of the genus , for which the names sp. nov. and sp. nov. are proposed, respectively. The type strains of and are R11 (=KACC 21228=JCM 33472) and S1162 (=KACC 21669=JCM 33916), respectively.