北京市の小児の手足口病（HFMD）の優勢病原体となった原因は，コキサッキーウイルスA6sのサブジェノタイプの変化と組換えである可能性が，全ゲノム配列の解析から明らかになった．

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Int. J. Infect. Dis..2020 Jul;S1201-9712(20)30553-1. doi: 10.1016/j.ijid.2020.07.010.Epub 2020-07-11.

北京市の小児の手足口病（HFMD）の優勢病原体となった原因は，コキサッキーウイルスA6sのサブジェノタイプの変化と組換えである可能性が，全ゲノム配列の解析から明らかになった．

Sub-genotype change and recombination of coxsackievirus A6s may be the cause of being predominant pathogen for HFMD in children in Beijing as revealed by analysis of complete genome sequences.

Fangyuan Yu
Runan Zhu
Liping Jia
Qinwei Song
Jie Deng
Liying Liu
Linqing Zhao
Yuan Qian

PMID: 32663604 DOI: 10.1016/j.ijid.2020.07.010.

抄録

目的:

中国北京市の小児における手足口病（HFMD）の最も優勢な病因となっていたエンテロウイルスA71（EV71）とコキサッキーウイルスA16（CVA16）に代わってコキサッキーウイルスA6（CVA6）が優勢になった理由を検討した．

OBJECTIVES: To investigate why coxsackievirus A6 (CVA6) had replaced enterovirus A71 (EV71) and coxsackievirus A16 (CVA16) which used to be the most predominant etiological agents for hand, foot and mouth disease (HFMD) in children in Beijing, China.

方法:

2010年から2016年に同定された合計64例のCVA6陽性サンプルを全ゲノム配列の増幅解析のために選択した。

METHODS: A total of 64 CVA6-positive samples identified from 2010 to 2016 were selected for whole-genome sequences amplification and analysis.

結果:

本研究で得られたCVA6sの全ゲノム配列は7432〜7435ヌクレオチドの長さであり、長さの違いは5'UTR領域のみであることが示された。CVA6sの全長VP1領域の系統樹解析の結果、北京で流行しているCVA6sは2013年に以前のD2サブジェノタイプからD3サブジェノタイプに変化したことが示された。本研究では、2010年と2011年を中心にCVA6の2つの組換え型（RF）-CとDが出現した。2013 年以降，北京の HFMD の小児では，RF-A，J，L の 3 つの組換え CVA6 変異体が流行している．RF-Jの組換え領域は2C領域に位置していたが、RF-Lは3D領域に新たな組換え点を有していた。2013年から2016年にかけて北京で流行したCVA6の組換えは、ゲノムの非capid領域、特にP2とP3の領域内で発生した。

RESULTS: It was demonstrated that the sequences for whole-genomes of CVA6s in this study were 7432∼7435 nucleotides in length, and the different lengths were only in the 5'UTR regions. The phylogenetic tree analysis of the full-length VP1 regions of CVA6s indicated that the prevalent CVA6s in Beijing changed from the previous D2 sub-genotype to the D3 sub-genotype in 2013. In this study, two recombinant froms (RFs)-C and D of CVA6 appeared mainly in 2010 and 2011. Since 2013, three recombinant CVA6 variants, RF-A, J and L, have been prevalent in children with HFMD in Beijing. The recombination region of RF-J was located at the 2C region, while RF-L had the new recombination point in the 3D region. The recombination of prevalent CVA6s in Beijing from 2013 to 2016 occurred within noncapid regions of the genome, especially the regions of the P2 and P3.

結論:

本研究から示唆されたCVA6のサブジェノタイプの変化と組換えは、2013年以降、CVA6がHFMDを引き起こす病原体として優勢になった理由を説明する可能性がある。

CONCLUSIONS: Sub-genotype change and recombination of CVA6s indicated from this study may explain why CVA6 has become the predominant pathogen causing HFMD since 2013.