眼病理学における補完的方法としてのホルマリン固定およびパラフィン包埋組織のRNAシーケンス

RNA Sequencing of Formalin-Fixed and Paraffin-Embedded Tissue as a Complementary Method in Ophthalmopathology.

• Günther Schlunck
• Stefaniya Boneva
• Julian Wolf
• Anja Schlecht
• Thomas Reinhard
• Claudia Auw-Hädrich
• Clemens Lange

抄録

次世代シークエンシング(NGS)のハイスループットメソッドは、サンプル中の数百万のRNA分子のヌクレオチド配列を費用対効果の高い方法で解読することを可能にします。これにより、組織や細胞内の異なるRNA分子の数を決定し、これらのデータを使用して結論を導き出すことが可能になります。RNAの全体、特にタンパク質の潜在的な前駆体としてのmRNA（メッセンジャーRNA）は、調査対象の細胞や組織の機能状態を包括的に把握することができます。この目的のために、細胞培養や未固定組織に加えて、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織も、特定の方法を用いて分析することができます。この概要では、その方法論的戦略と眼科組織病理学の分野への応用について紹介します。

The high-throughput method of "Next Generation Sequencing" (NGS) allows cost-effective decoding of the nucleotide sequences of millions of RNA molecules in a sample. This makes it possible to determine the number of distinct RNA molecules in tissues or cells and to use these data to draw conclusions. The entirety of RNAs, in particular mRNAs (messenger RNAs) as potential precursors of proteins, provides a comprehensive insight into the functional state of the cells and tissues under investigation. In addition to cell cultures or unfixed tissue, formalin-fixed and paraffin-embedded (FFPE) tissue can also be analysed for this purpose using specific methods. In this overview, the methodological strategy and its application to the field of ophthalmic histopathology are presented.

次世代シークエンシング(Next Generation Sequencing) (NGS)は、数百万個のRNA-モルモットの核酸配列をプローブに入れて、数百万個のRNA-モルモットの核酸配列の解析を可能にします。Diesは、Die Anzumgöllicht, die Anzahl unchiedlicherle in Gewebeverbänden oder Einzelzellen zu bestimmen und daraus Rückslchüsse zu ziehen.ここでは、RNA、特にmRNA（メッセンジャーRNA）は、タンパク質の発現を決定するための包括的な情報を提供していますが、einen umfassenden Einblick in denktionszustand der untertsuchtenzellen und Gewebe。このような場合には、細胞膜または細胞膜の表面には、ホルミル固定法およびパラフィン（FFPE）中でのホルミル固定法が適用されます。このセクションでは、方法の戦略および眼科組織病理学の病理組織学的研究に使用される方法を示しています。

Hochdurchsatzverfahren des „Next Generation Sequencing“ (NGS) erlauben es, kostengünstig die Nukleotidsequenzen von Millionen von RNA-Molekülen in einer Probe zu entschlüsseln. Dies ermöglicht, die Anzahl unterschiedlicher RNA-Moleküle in Gewebeverbänden oder Einzelzellen zu bestimmen und daraus Rückschlüsse zu ziehen. Dabei gibt die Gesamtheit der RNAs, insbesondere der mRNAs (messenger RNAs) als potenzielle Vorlagen für die Proteinexpression, einen umfassenden Einblick in den Funktionszustand der untersuchten Zellen und Gewebe. Hierfür können neben Zellkulturen oder frischem Gewebe mit speziellen Methoden auch formalinfixierte und in Paraffin (FFPE) eingebettete Präparate genutzt werden. In dieser Übersicht werden die methodische Strategie und ihr Einsatz im Bereich der ophthalmologischen Histopathologie dargestellt.

Georg Thieme Verlag KG Stuttgart · New York.