全エクソームシークエンシングによるTelangiectasiaの患者からの2つの新規遺伝子変異の同定

Identification of Two Novel Mutations in the Gene from Patients with Ataxia-Telangiectasia by Whole Exome Sequencing.

• Masoud Heidari
• Morteza Soleyman-Nejad
• Mohammad H Taskhiri
• Javad Shahpouri
• Alireza Isazadeh
• Roghayyeh Ahangari
• Ali R Mohamadi
• Masoumeh Ebrahimi
• Hadi Karimi
• Manzar Bolhassani
• Zahra Karimi
• Mansour Heidari

抄録

背景:

毛細血管拡張失調症（AT）は、小児期に発症する最も一般的な常染色体劣性遺伝性失調症の一つである。ATの原因遺伝子であるATM(AT, mutated)は、細胞周期チェックポイントや遺伝毒性に対する反応に関与するタンパク質をコードしている。本研究では、イランの血縁関係のない2つの失調症テランゲエクスタシアの家族における2つの新規な疾患原因遺伝子変異について報告する。

Background: Ataxia telangiectasia (AT) is one of the most common autosomal recessive hereditary ataxia presenting in childhood. The responsible gene for AT designated ATM (AT, mutated) encodes a protein which is involved in cell cycle checkpoints and other responses to genotoxicity. We describe two novel disease-causing mutations in two unrelated Iranian families with Ataxia-telangiectasia.

研究方法:

イランの2つの異なる家族の中で、6歳の女性と18歳の男の子を含むプロバンドがAtaxia-telangiectasiaと診断された。本研究では、プロバンドの遺伝的変化の検出にWhole-Exome Sequencing (WES)を用いた。また、PCR直接塩基配列決定法を用いて、家族における疾患と変異体の共棲関係を解析した。

Methods: The probands including a 6-year-old female and an 18-year-old boy were diagnosed with Ataxia-telangiectasia among two different Iranian families. In this study, Whole-Exome Sequencing (WES) was employed for the detection of genetic changes in probands. The analysis of the co-segregation of the variants with the disease in families was conducted using PCR direct sequencing.

結果:

失調性毛細血管拡張症突然変異ATM遺伝子の2つの新規フレームシフト変異（c.4236_4236del p. Pro1412fs）と（c.8907T>G p. Tyr2969Ter）が、全ゲノムシークエンシング（WES）を用いてプロブンドで検出された。これらの変異は、2つの別々のA-Tファミリーで観察された。

Results: Two novel frameshift mutations, (c.4236_4236del p. Pro1412fs) and (c.8907T>G p. Tyr2969Ter) in the ataxia telangiectasia mutated ATM gene were detected using Whole-Exome Sequencing (WES) in the probands. These mutations were observed in two separate A-T families.

結論:

次世代シークエンシングにより、失調症・テランゲエクスタシアの家族において、原因となる突然変異を同定することに成功した。本研究で報告されたATM遺伝子の新規変異は、失調症の遺伝カウンセリング、着床前遺伝子診断（PGD）、出生前診断（PND）の一助となる可能性がある。

Conclusion: Next-generation sequencing successfully identified the causative mutation in families with ataxia-telangiectasia. These novel mutations in the ATM gene reported in the present study could assist genetic counseling, Preimplantation Genetic Diagnosis (PGD) and prenatal diagnosis (PND) of AT.

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