2010年から2018年までに台湾で分離された鳥類パラミクソウイルス1の系統解析と渡り鳥による大陸間分散のエビデンス

Phylogenetic analysis of avian paramyxoviruses 1 isolated in Taiwan from 2010 to 2018 and evidence for their intercontinental dispersal by migratory birds.

• Yu-Pin Liu
• Chiu-Yen Chang
• Fan Lee
• Chwei-Jang Chiou
• Hsiang-Jung Tsai

抄録

ニューカッスル病ウイルス（NDV）の代名詞である鳥類パラミクソウイルス1（APMV-1）は、様々な鳥類に感染し、ニューカッスル病の発生の原因となる世界的なウイルス剤である。本研究では、2010年から2018年の間に台湾の家禽、渡り鳥、留鳥から採取したAPMV-1分離株40株を遺伝学的に特徴づけた。我々のAPMV-1分離株の完全融合タンパク質遺伝子の系統解析の結果、台湾の40株中39株がクラスI遺伝子型1またはクラスII遺伝子型I、VIまたはVIIのAPMV-1と密接に関連しており、1株はクラスIサブ遺伝子型1.2内に入れ子になった分岐（旧1d）の融合タンパク質遺伝子配列は、北米の野鳥から分離されたものと密接に関連していた。クラスIIのサブジェノタイプVI.2.1.1.2.1およびサブジェノタイプVI.2.1.1.2.2に配置されたウイルスは、過去10年間に台湾で流通しているハトパラミクソウイルス1（PPMV-1）の支配的なウイルスであった。ニューカッスル病発生関連分離株はすべてクラスIIのサブジェノタイプVII.1.1.1に属し，台湾でのニューカッスル病発生の主な原因となっていた．以上のことから，少なくとも5種類のAPMV-1が台湾の複数の鳥類宿主種に分布していることが示唆された．遺伝的に分岐したAPMV-1の1つのグループは，クラスIの中では新規遺伝子型と考えられる．

Avian paramyxovirus 1 (APMV-1), synonymous with Newcastle disease virus (NDV), is a worldwide viral agent that infects various avian species and responsible for outbreaks of Newcastle disease. In this study, 40 APMV-1 isolates collected from poultry, migratory birds, and resident birds during 2010-2018 in Taiwan were characterized genetically. Our phylogenetic analysis of complete fusion protein gene of the APMV-1 isolates revealed that 39 of the 40 Taiwanese isolates were closely related to APMV-1 of class I genotype 1 or class II genotypes I, VI or VII, and one isolate belonged to a group that can be classified as a novel genotype 2 within class I. The fusion protein gene sequences of a branch (former 1d) nested within class I sub-genotype 1.2 were closely related to those isolated from wild birds in North America. Viruses placed in class II sub-genotype VI.2.1.1.2.1 and sub-genotype VI.2.1.1.2.2 were the dominant pigeon paramyxovirus 1 (PPMV-1) circulating in the last decade in Taiwan. All the Newcastle disease outbreak-associated isolates belonged to class II sub-genotype VII.1.1, which was mainly responsible for the present epizootic of Newcastle disease in Taiwan. We conclude that at least five sub/genotypes of APMV-1 circulate in multiple avian host species in Taiwan. One genetically divergent group of APMV-1 should be considered as a novel genotype within class I. Migratory birds may play an important role in intercontinental spread of lentogenic APMV-1 between Eurasia and North America.