タンザニアのコミュニティ設定で、HIV感染成人から分離された肺炎球菌の間で、抗菌薬耐性とジヒドロ葉酸還元酵素遺伝子の多重変異が高い割合で認められた

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J Glob Antimicrob Resist.2020 Jul;S2213-7165(20)30171-5. doi: 10.1016/j.jgar.2020.06.026.Epub 2020-07-09.

タンザニアのコミュニティ設定で、HIV感染成人から分離された肺炎球菌の間で、抗菌薬耐性とジヒドロ葉酸還元酵素遺伝子の多重変異が高い割合で認められた

High rate of antimicrobial resistance and multiple mutations in dihydrofolate reductase gene among Streptococcus pneumoniae isolated from HIV-infected adults in a community setting in Tanzania.

Joel Manyahi
Sabrina Moyo
Said Aboud
Nina Langeland
Bjørn Blomberg

PMID: 32653726 DOI: 10.1016/j.jgar.2020.06.026.

抄録

目的:

本研究は、タンザニア・ダルエスサラームのHIV感染成人から分離された肺炎球菌のトリメトプリム耐性と抗生物質耐性の分子機構を明らかにするものである。

OBJECTIVES: This study characterizes the molecular mechanisms of trimethoprim resistance and antibiotics resistance of Streptococcus pneumoniae isolates from HIV-infected adults in Dar es Salaam, Tanzania.

方法:

無作為化臨床試験CoTrimResist（ClinicalTrials.gov 識別子：NCT03087890）の一環として、2017年から2018年までの1年間の追跡調査期間中に、4回の診療所受診で新たにHIV感染と診断された537人から合計1877本の鼻咽頭スワブを採取し、肺炎球菌の結腸の有無をスクリーニングした。

METHODS: A total of 1877 nasopharyngeal swabs were collected and screened for pneumococcal colonization from 537 newly diagnosed individuals with HIV at four clinic visits during a one-year follow-up from 2017 -2018 as part of the randomized clinical trial CoTrimResist (ClinicalTrials.gov identifier: NCT03087890).

結果:

合計 76 個の肺炎球菌分離株が得られた．血清型判定が可能な分離株の60％（42/70株）は，肺炎球菌コンジュゲートワクチンの血清型である肺炎球菌コンジュゲートワクチン23（PCV23）であった．大多数（73.7％、56/76株）はペニシリン非感受性の最小抑制濃度（MIC）0.06～2μg//mlであった。コトリモキサゾール（71.1％）に耐性を示す株が多かったが，アジスロマイシン（22.4％），エリスロマイシン（21.1％），クロラムフェニコール（18.4％），テトラサイクリン（14.5％），クリンダマイシン（10.5％），レボフロキサシン（0株）には耐性を示す株はなかった。26％は多剤耐性（3種以上の抗生物質クラスに耐性）であった。ワクチン型肺炎球菌は、より多くのクラスの抗生物質に対して耐性を示し、エリスロマイシン、アジスロマイシン、クリンダマイシン、テトラサイクリンに対してより多くの耐性を示し、ペニシリンに対して高いMIC値を示した（中央値0.19；範囲0.002～1.5）。コトリモキサゾール耐性株はジヒドロ葉酸還元酵素遺伝子に1～11種類の変異を有しており，最も多かったのはIle100Leu（100％），Glu20Asp（92％），Glu94Asp（61％），Leu135Phe（57％），His26Tyr（53％），Asp92Ala（53％），His120Gln（53％）であった。

RESULTS: A total of 76 pneumococcal isolates were obtained. Sixty percent (42/70) of isolates that could be serotyped were conjugate vaccine serotypes, pneumococcal conjugate vaccine 23 (PCV23). The majority (73.7%, 56/76) was penicillin non-susceptible minimum inhibitory concentration (MIC) 0.06 - 2 μg//ml. Isolates were frequently resistant to cotrimoxazole (71.1%) but less so to azithromycin (22.4%), erythromycin (21.1%), chloramphenicol (18.4%), tetracycline (14.5%), clindamycin (10.5%) and levofloxacin (none). Twenty-six percent were multi-drug resistant (resistant to ≥3 antibiotic classes). Vaccine-type pneumococci were resistant to more classes of antibiotics; more frequently resistant to erythromycin, azithromycin, clindamycin and tetracycline, and had higher MIC-values towards penicillin (Median 0.19; range 0.002-1.5) versus non-vaccine types (Median 0.125; range 0.012-0.25), p = 0.003. Cotrimoxazole-resistant isolates carried from 1 to 11 different mutations in dihydrofolate reductase gene, the most common being Ile100Leu (100%), Glu20Asp (92%), Glu94Asp (61%), Leu135Phe (57%), His26Tyr (53%), Asp92Ala (53%) and His120Gln (53%).

結論:

結論HIV感染者から分離された肺炎球菌は，ペニシリンやコトリモキサゾールに感受性を示さないことが多かった。ほとんどの分離株はジヒドロ葉酸還元酵素遺伝子に複数の変異を有していた。

CONCLUSIONS: In conclusionStreptococcus pneumoniae isolated from HIV-diagnosed patients were frequently non-susceptible to penicillin and cotrimoxazole. Most isolates carried multiple mutations in the dihydrofolate reductase gene.