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無煙タバコ使用者の舌マイクロバイオーム
Tongue microbiome of smokeless tobacco users.
PMID: 32640977 PMCID: PMC7346439. DOI: 10.1186/s12866-020-01883-8.
抄録
背景:
無煙タバコが口腔内マイクロバイオームに影響を与えて口腔発がんに寄与する可能性については、これまで検討されてこなかった。この予備的な横断的研究では、アラビアで普及している無煙タバコの一形態であるシャンマーの使用が舌マイクロバイオームに及ぼす影響を評価しようとした。シャンマー使用者29名（SU、27.34±6.9歳）および非使用者23名（SNU、27.7±7.19歳）から舌瘢痕サンプルを採取し、16S rRNA遺伝子シークエンシング（V1～V3）で解析した。高品質でマージされたリードの種レベルの分類学的割り当ては、以前に記述されたBLASTnベースのアルゴリズムを使用して得られた。ダウンストリーム解析はQIIME、LEfSe、Rを用いて行った。
BACKGROUND: The possibility that smokeless tobacco may contribute to oral carcinogenesis by influencing the oral microbiome has not been explored. This preliminary cross-sectional study sought to assess the effect of using shammah, a form of smokeless tobacco prevalent in Arabia, on the tongue microbiome. Tongue scarping samples were obtained from 29 shammah users (SU; 27.34 ± 6.9 years) and 23 shammah non-users (SNU; 27.7 ± 7.19 years) and analyzed with 16S rRNA gene sequencing (V1-V3). Species-level taxonomy assignment of the high-quality, merged reads was obtained using a previously described BLASTn-based algorithm. Downstream analyses were performed with QIIME, LEfSe, and R.
結果:
62属8系統に属する178種が同定された。Streptococcus属、Leptotrichia属、Actinomyces属、Veillonella属、Haemophilus属、Prevotella属、Neisseria属が平均マイクロバイオームの60％以上を占めた。種の豊富さとα多様性には両群間で差はなかったが、PCoAは有意な分離を示した（P=0.015、ANOSIM）。LEfSe解析では、SU群とSNU群の間で差のある22種が同定された。しかし、7種のみが偽発見率≤0.2を維持し、2つのグループを別々にクラスター化することができた。Rothia mucilaginosa、Streptococcus sp. oral taxon 66、Actinomyces meyeri、Streptococcus vestibularis Streptococcus sanguinis、およびSUに関連する潜在的に新規なVeylorella種、およびSNUに関連するOribacterium asaccharolyticumであった。
RESULTS: A total of 178 species, belonging to 62 genera and 8 phyla were identified. Genera Streptococcus, Leptotrichia, Actinomyces, Veillonella, Haemophilus, Prevotella and Neisseria accounted for more than 60% of the average microbiome. There were no differences between the two groups in species richness and alpha-diversity, but PCoA showed significant separation (P = 0.015, ANOSIM). LEfSe analysis identified 22 species to be differentially abundant between the SU and SNU. However, only 7 species maintained a false discovery rate of ≤0.2 and could cluster the two groups separately: Rothia mucilaginosa, Streptococcus sp. oral taxon 66, Actinomyces meyeri, Streptococcus vestibularis Streptococcus sanguinis and a potentially novel Veillonella species in association with SU, and Oribacterium asaccharolyticum with SNU.
結論:
これらの予備的な結果は、シャンマーの使用が、アセトアルデヒド産生能の高いいくつかの種の濃縮を含む舌マイクロバイオームの変化を誘導することを示しており、さらなる調査が必要であることを示している。
CONCLUSION: These preliminary results indicate that shammah use induces tongue microbiome changes including enrichment of several species with high acetaldehyde production potential, which warrants further investigation.