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Wiley Interdiscip Rev RNA.2020 Jul;:e1616. doi: 10.1002/wrna.1616.Epub 2020-07-06.

同じメダルの表裏一体。ノンコーディング変異は新たな病理学的メカニズムを明らかにし、遺伝子発現の制御への洞察をもたらします

Two sides of the same medal: Noncoding mutations reveal new pathological mechanisms and insights into the regulation of gene expression.

  • Amelie S Wachs
  • Jens Bohne
PMID: 32633083 DOI: 10.1002/wrna.1616.

抄録

ノンコーディング配列はヒトゲノムの大部分を占めており、プレmRNAも含まれています。これらの領域の一塩基変異は見落とされがちですが、観察されている表現型の変化の多くの原因となっている可能性があります。プレmRNAのノンコーディング部分の変異は、しばしば細胞内遺伝子発現の制御に関する新たな意義ある洞察を明らかにします。したがって、このような突然変異の病理学的メカニズムをメカニズム論的に解析することは、疾患とその根底にある細胞経路の理解を深めることになる。一次mRNA配列はアミノ酸をコードするだけでなく、RNA結合タンパク質や二次構造の情報も暗号化しているため、同義変異であっても病気を引き起こす可能性があります。実際、RNA配列は、特定のmRNP複合体の組み立てを指示し、その複合体がmRNAの運命を決定したり、その生合成を制御したりする。ゲノム配列情報の蓄積は急速に増加している。しかし、発見された多様性の多くは、特定の症候群や疾患の表現型を説明できない可能性がある。そのためには、ゲノムワイドな研究やバイオインフォマティクスのアプローチを補完する病理メカニズム研究の重要性も強調している。この記事は以下のカテゴリに分類されます。RNAプロセシング > スプライシング制御/代替スプライシング RNAプロセシング > 3'エンドプロセシング RNA 疾患と発生におけるRNA > 疾患におけるRNA。

Noncoding sequences constitute the major part of the human genome and also of pre-mRNAs. Single nucleotide variants in these regions are often overlooked, but may be responsible for much of the variation of phenotypes observed. Mutations in the noncoding part of pre-mRNAs often reveal new and meaningful insights into the regulation of cellular gene expression. Thus, the mechanistic analysis of the pathological mechanism of such mutations will both foster a deeper understanding of the disease and the underlying cellular pathways. Even synonymous mutations can cause diseases, since the primary mRNA sequence not only encodes amino acids, but also encrypts information on RNA-binding proteins and secondary structure. In fact, the RNA sequence directs assembly of a specific mRNP complex, which in turn dictates the fate of the mRNA or regulates its biogenesis. The accumulation of genomic sequence information is increasing at a rapid pace. However, much of the diversity uncovered may not explain the phenotype of a certain syndrome or disease. For this reason, we also emphasize the value of mechanistic studies on pathological mechanisms being complementary to genome-wide studies and bioinformatic approaches. This article is categorized under: RNA Processing > Splicing Regulation/Alternative Splicing RNA Processing > 3' End Processing RNA in Disease and Development > RNA in Disease.

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