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α-1抗トリプシン欠損多能性幹細胞の高度に表現型化されたオープンアクセスリポジトリ
A Highly Phenotyped Open Access Repository of Alpha-1 Antitrypsin Deficiency Pluripotent Stem Cells.
PMID: 32619491 PMCID: PMC7363960. DOI: 10.1016/j.stemcr.2020.06.006.
抄録
α-1抗トリプシン欠損症（AATD）という遺伝的疾患を持つ患者は、肺疾患や肝臓疾患を発症するリスクがある。患者誘導多能性幹細胞（iPSC）は、AATDの病態の特徴をモデル化することがわかっているが、AATD患者のiPSC株はほんの一握りしか発表されていない。AATD患者の表現型の多様性を把握するために、我々はAATD患者のiPSCと関連する疾患関連の臨床データを収集したリポジトリを構築し、その特徴を明らかにした。リポジトリの有用性を強調するために、機能的特徴付けのためにiPSC株のサブセットを選択した。選択したiPSC株は分化して肝細胞と肺細胞の両方の細胞株を生成し、RNAシークエンシングで解析した。さらに、2つのiPSC株をCRISPR/Cas9編集を用いて標的化し、傷跡のない修復を達成した。リポジトリiPSCは、疾患の病態解明や治療法の発見のために研究者が利用できるようになっています。
Individuals with the genetic disorder alpha-1 antitrypsin deficiency (AATD) are at risk of developing lung and liver disease. Patient induced pluripotent stem cells (iPSCs) have been found to model features of AATD pathogenesis but only a handful of AATD patient iPSC lines have been published. To capture the significant phenotypic diversity of the patient population, we describe here the establishment and characterization of a curated repository of AATD iPSCs with associated disease-relevant clinical data. To highlight the utility of the repository, we selected a subset of iPSC lines for functional characterization. Selected lines were differentiated to generate both hepatic and lung cell lineages and analyzed by RNA sequencing. In addition, two iPSC lines were targeted using CRISPR/Cas9 editing to accomplish scarless repair. Repository iPSCs are available to investigators for studies of disease pathogenesis and therapeutic discovery.
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