変形性関節症とヒト血漿蛋白質の遺伝的関係の評価：大規模な遺伝的相関スキャン

Assessing the genetic relationships between osteoarthritis and human plasma proteins: a large scale genetic correlation scan.

• Li Liu
• Sen Wang
• Yan Wen
• Ping Li
• Shiqiang Cheng
• Mei Ma
• Lu Zhang
• Bolun Cheng
• Xin Qi
• Chujun Liang
• Feng Zhang

抄録

研究の背景:

変形性関節症（OA）は多因子複合疾患である。血漿蛋白質が変形性関節症に与える影響については、現在も不明な点が多い。

Background: Osteoarthritis (OA) is a multifactorial complex disease. The impact of plasma proteins on OA remains elusive now.

方法:

ここでは、UK BiobankのOAのゲノムワイド関連研究データを用いた。ゲノムワイドSNPジェノタイピングは、Affymetrix UK BiLEVE AxiomまたはUK Biobank Axiomアレイを用いて行った。同様に、3,622個の血漿蛋白質のGWAS要約データは、最近発表された研究から得たものである。その結果、各血漿タンパク質とOAの異なる部位との間の遺伝的相関を評価するために、連結不平衡スコア回帰（LDスコア回帰）分析を実施した。

Methods: The UK Biobank genome-wide association study data of OA was used here. Genome-wide SNP genotyping was performed using the Affymetrix UK BiLEVE Axiom or UK Biobank Axiom array. Equally, the GWAS summary data of 3,622 plasma proteins was derived from a recently published study. Consequently, linkage disequilibrium score regression (LD score regression) analysis was performed to evaluate the genetic correlation between each plasma protein and different sites of OA.

結果:

その結果、いくつかの示唆に富む血漿蛋白質がOAに関連していることが明らかになった。手のOAでは、インターアルファトリプシン阻害剤重鎖H1（係数＝0.3854、P値＝0.0198）、多重イノシトールポリリン酸ホスファターゼ1（係数＝1.1721、P値＝0.0303）に遺伝的相関の証拠が観察された。股関節OAでは、膜貫通糖タンパク質NMB（係数=0.6944、P値=0.0098）、内皮細胞特異的分子1（係数=0.6337、P値=0.03）など、7つの示唆的な遺伝的相関が認められた。膝OAについては、Elafin（係数=0.5562、P値=0.0092）、Interleukin-16（係数=0.3949、P値=0.0435）を含む12の示唆的な遺伝的相関シグナルが同定された。

Results: Several suggestive plasma proteins were identified for OA. For hand OA, evidence of genetic correlation was observed for inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H1 (coefficient =-0.3854, P value =0.0198), multiple inositol polyphosphate phosphatase 1 (coefficient =-1.1721, P value =0.0303). For hip OA, 7 suggestive genetic correlation signals were observed, such as Transmembrane glycoprotein NMB (coefficient =0.6944, P value =0.0098), Endothelial cell-specific molecule 1 (coefficient =0.6337, P value =0.03). For Knee OA, 12 suggestive genetic correlation signals were identified, including Elafin (coefficient =-0.5562, P value =0.0092), Interleukin-16 (coefficient =0.3949, P value =0.0435).

結論:

我々は、血漿タンパク質とOAの異なる部位との間の遺伝的相関を系統的に調べた。この結果は、OAが異種疾患であることを示す新たな証拠となりました。

Conclusions: We investigated the genetic correlations between plasma proteins and different sites of OA in a systematic way. Our results provide novel evidence that OA is a heterogeneous disease.

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