中国人患者の肺扁平上皮癌のプロテオミクスおよびリン酸化プロテオミクスマップ

Proteomic and Phosphoproteomic Maps of Lung Squamous Cell Carcinoma From Chinese Patients.

• Lulu Pan
• Xijun Wang
• Longhai Yang
• Lei Zhao
• Linhui Zhai
• Junyu Xu
• Yikun Yang
• Yousheng Mao
• Shujun Cheng
• Ting Xiao
• Minjia Tan

抄録

肺扁平上皮癌（LUSC）は、世界の腫瘍による死亡原因の主要なものの一つである。これまでのところ、ゲノムレベルでのLUSCの腫瘍の異質性に関する研究では、治療上の有益性は限られていることが明らかにされているにすぎない。したがって、プロテオミクスレベルでのLUSCのシステム全体の研究は、個々の要求に応じた精密医療戦略をさらに向上させる可能性がある。この目的のために、我々は25名の中国人患者のLUSCサンプルを対象にプロテオミクスおよびリン酸化プロテオミクス研究を行った。その結果、プロテオミクスデータに基づく2つのサブグループ（クラスターIとクラスターII）が同定され、これらのサブグループは異なる分子的特徴と臨床病理学的特徴に関連していた。その結果、クラスターIではスプライスソーム経路に富み、クラスターIIでは焦点接着経路、免疫関連経路、Rasシグナル経路に富むことが明らかになった。さらに、リンパ節転移（LNM）は我々のプロテオミクスサブグループと関連しており、LNM患者では細胞周期経路が濃縮されていることがわかった。さらに、細胞周期経路に関与するDNA複製ライセンス因子であるMCM2が予後不良の患者で高発現していることを示し、免疫組織化学（IHC）解析によりさらに証明された。以上のことから、本研究は中国のLUSC患者のプロテオミクスおよびリンプロテオミクスの特徴を明らかにした。

Lung squamous cell carcinoma (LUSC) is one of the leading causes of tumor-driven deaths in the world. To date, studies on the tumor heterogeneity of LUSC at genomic level have only revealed limited therapeutic benefits. Therefore, system-wide research of LUSC at proteomic level may further improve precision medicine strategies on individual demands. To this end, we performed proteomic and phosphoproteomic study for LUSC samples of 25 Chinese patients. From our results, two subgroups (Cluster I and II) based on proteomic data were identified, which were associated with distinct molecular characteristics and clinicopathologic features. Combined with phosphoproteomic data, our result showed that spliceosome pathway was enriched in Cluster I, while focal adhesion pathway, immune-related pathways and Ras signaling pathway were enriched in Cluster II. In addition, we found that lymph node metastasis (LNM) was associated with our proteomic subgroups and cell cycle pathway was enriched in patients with LNM. Further analysis showed that MCM2, a DNA replication licensing factor involved in cell cycle pathway, was highly expressed in patients with poor prognosis, which was further proved by immunohistochemistry (IHC) analysis. In summary, our study provided a resource of the proteomic and phosphoproteomic features of LUSC in Chinese patients.

Copyright © 2020 Pan, Wang, Yang, Zhao, Zhai, Xu, Yang, Mao, Cheng, Xiao and Tan.