2つの多様なCaulobacter phicbkvirus粒子に関連するタンパク質の同定

Identification of proteins associated with two diverse Caulobacter phicbkvirus particles.

• Kiesha Wilson
• Fanchao Zhu
• Ran Zheng
• Sixue Chen
• Bert Ely

抄録

Caulobacter crescentusに感染するバクテリオファージ間のゲノム進化は避けられない。しかし、無傷のファージ粒子に関連するタンパク質の保存性については、これまで検討されてこなかった。本研究では、ゲノム的には多様であるが形態的には類似したC. crescentus感染バクテリオファージであるphiCbKとCcrSCの構造タンパク質を比較した。両ファージのバクテリオファージ粒子の一部である20種類以上のタンパク質を検出することができたが、2つのファージ粒子のうちの1つだけに見られる少数のタンパク質を同定することができた。これらの構造タンパク質をコードする遺伝子のうち、1つを除いてすべてが構造領域と指定されていたゲノムの領域に位置していたことから、これらのファージのゲノムに含まれる遺伝子が機能に応じてクラスター化されているという考えが確認されました。また、精製過程では、細胞溶解液から回収できる複製複合体をphiCbkが持っていることを発見し、この複合体によってファージゲノムの複製に関与する多くのファージタンパク質を同定することができました。

Genomic evolution among bacteriophages infecting Caulobacter crescentus is inevitable. However, the conservation of the proteins associated with intact phage particles has not been investigated. In this study, we compared the structural proteins associated with two genomically diverse but morphologically similar C. crescentus-infecting bacteriophages, phiCbK and CcrSC. We were able to detect more than 20 proteins that are part of the bacteriophage particle in both phages, and we were able to identify a small number of proteins that were found in only one of the two phage particles. All but one of the genes coding for these structural proteins were located in a region of the genome that had been designated a structural region, confirming the idea that the genes in these phage genomes are clustered according to their function. During the purification process, we also discovered that phiCbk has a replication complex that can be recovered from the cell lysate, and this complex allowed us to identify many of the phage proteins involved in phage genome replication.