アマゾンのネイティブアメリカン集団における急性リンパ芽球性白血病の毒性に関連する薬理遺伝学的マーカーの特性化

Characterization of pharmacogenetic markers related to Acute Lymphoblastic Leukemia toxicity in Amazonian native Americans population.

• Darlen Cardoso de Carvalho
• Alayde Vieira Wanderley
• André Mauricio Ribeiro Dos Santos
• Fabiano Cordeiro Moreira
• Roberta Borges Andrade de Sá
• Marianne Rodrigues Fernandes
• Antonio André Conde Modesto
• Tatiane Piedade de Souza
• Amanda Cohen-Paes
• Luciana Pereira Colares Leitão
• Juliana Carla Gomes Rodrigues
• Artur Luiz da Costa da Silva
• João Farias Guerreiro
• Sidney Santos
• André Salim Khayat
• Paulo Pimentel de Assumpção
• Ney Pereira Carneiro Dos Santos

抄録

急性リンパ芽球性白血病（ALL）は小児の最も一般的な癌である。小児ALLの治療成績には民族間で差が見られる。一般的に、ネイティブアメリカンの祖先を多く持つ小児はALL治療にあまり積極的に反応しない傾向があり、これはネイティブアメリカンの集団に見られる特定のゲノム変異と関連している可能性がある。このような証拠にもかかわらず、アマゾン地域のような伝統的なアメリカ人集団におけるALL治療に関連する薬理遺伝学的変異の分布に関するデータはほとんどない。そこで本研究では、ブラジル・アマゾンのアメリカ人におけるALL治療に関連する27の分子マーカーを調査し、1,000ゲノムデータベースに登録されている5大陸で以前に記録されたものと頻度を比較した。集団間の遺伝子型頻度の変動は、フィッシャーの厳密検定を用いて評価した。多重解析の結果の修正には偽発見率法を用いた。その結果、アメリカインディアン集団と世界の他の地域の集団との間で、大部分のマーカーの頻度に有意な差が認められた。これらの知見は、ブラジル・アマゾンの先住民集団のユニークな遺伝的プロファイルを強調しており、これらの集団におけるALL治療のための明確な治療プロファイルを反映している可能性がある。

Acute Lymphoblastic Leukemia (ALL) is the most common cancer in children. Differences are found among ethnic groups in the results of the treatment of pediatric ALL. In general, children with a high level of native American ancestry tend to respond less positively to ALL treatments, which may be related to specific genomic variants found in native American groups. Despite the evidence, few data are available on the distribution of the pharmacogenomic variants relevant to the treatment of ALL in traditional Amerindian populations, such the those of the Amazon region. Given this, the present study investigated 27 molecular markers related to the treatment of ALL in Amerindians from Brazilian Amazonia and compared the frequencies with those recorded previously on five continents, that are available in the 1,000 Genomes database. The variation in the genotype frequencies among populations was evaluated using Fisher's exact test. The False Discovery Rate method was used to correct the results of the multiple analyses. Significant differences were found in the frequencies of the majority of markers between the Amerindian populations and those of other regions around the world. These findings highlight the unique genetic profile of the indigenous population of Brazilian Amazonia, which may reflect a distinct therapeutic profile for the treatment of ALL in these populations.