パレティック病を発症した都市部の野鳥におけるウイルス多様性のメタトランスクリプトーム解析

Meta-transcriptomic analysis of virus diversity in urban wild birds with paretic disease.

• Wei-Shan Chang
• John-Sebastian Eden
• Jane Hall
• Mang Shi
• Karrie Rose
• Edward C Holmes

抄録

野鳥は、様々な感染症の主要な自然の貯蔵庫であり、潜在的な飛散源でもあります。そのため、野鳥が媒介するウイルスの多様性を明らかにし、この情報を用いて人間や家畜、その他の野生動物への潜在的な感染リスクの理解に役立てることが重要である。我々は、オーストラリアの野生鳥類における長年にわたり診断されていない疾患症候群において、パレシスの原因となる可能性のあるウイルスを調査した。罹患鳥からRNAを抽出し、組織型、宿主種、臨床症状に基づいてプールし、メタゲノムシークエンシングを行った。大量かつ偏りのないメタトランスクリプトーム法を用いて、臨床調査と病理組織学を組み合わせて、オーストラリアのカササギ、カササギラーク、パイドキュロン、オーストラリアのカラス、レインボーロリカケッツなど、オーストラリアの野鳥の家族や一般的な都市部の野鳥に生息する数多くの新規ウイルスを同定しました。いずれの場合も、RT-PCRによりウイルスの存在が確認された。これらのデータから、カササギ科の鳥類では冠状動脈、骨格筋、血管、神経病理に寄与する可能性のあるウイルス病原体の候補が多数存在することが明らかになった。都市部の鳥類にこのような多様なウイルスが存在することは、都市環境における野生動物の病原体の病因と生態を解明する上での重要性と課題を浮き彫りにした。この情報は、疾病リスクを管理し、野生動物、家畜、人間の健康に対する潜在的なウイルスの脅威のサーベイランスを行う上で、ますます重要になってくるだろう。野生動物は自然に多様な感染性微生物を保有しており、家畜やヒトの集団における新規疾患の発生源となる可能性がある。私たちは、偏りのない RNA シーケンシングを用いて、オーストラリアの都市環境に生息する鳥類の中から、非常に多様性の高いウイルスを同定しました。この研究では、原因不明の原因不明の再発性症候群である、クレンチクロー症候群や黒鳥・白鳥病の臨床調査と説明が行われました。この研究では、病気を引き起こす可能性のあるウイルス性病原体の範囲を特定するだけでなく、放し飼いの野生動物における出現した病気の症候群を効果的かつ効率的に特徴づけることができる方法を説明し、潜在的な保全と人獣共通感染症の懸念のある特定の病原体のさらなるサーベイランスを促進します。

Wild birds are major natural reservoirs and potential dispersers of a variety of infectious diseases. As such, it is important to determine the diversity of viruses they carry and use this information to help understand the potential risks of spill-over to humans, domestic animals, and other wildlife. We investigated the potential viral causes of paresis in long-standing, but undiagnosed, disease syndromes in wild Australian birds. RNA from diseased birds was extracted and pooled based on tissue type, host species and clinical manifestation for metagenomic sequencing. Using a bulk and unbiased meta-transcriptomic approach, combined with clinical investigation and histopathology, we identified a number of novel viruses from the families and in common urban wild birds including Australian magpies, magpie larks, pied currawongs, Australian ravens, and rainbow lorikeets. In each case the presence of the virus was confirmed by RT-PCR. These data revealed a number of candidate viral pathogens that may contribute to coronary, skeletal muscle, vascular and neuropathology in birds of the and families, and neuropathology in members of the The existence of such a diverse virome in urban avian species highlights the importance and challenges in elucidating the etiology and ecology of wildlife pathogens in urban environments. This information will be increasingly important for managing disease risks and conducting surveillance for potential viral threats to wildlife, livestock and human health. Wildlife naturally harbor a diverse array of infectious microorganisms and can be a source of novel diseases in domestic animals and human populations. Using unbiased RNA sequencing we identified highly diverse viruses in native birds from Australian urban environments presenting with paresis. This research included the clinical investigation and description of poorly understood recurring syndromes of unknown etiology: clenched claw syndrome, and black and white bird disease. As well as identifying a range of potentially disease-causing viral pathogens, this study describes methods that can effectively and efficiently characterize emergent disease syndromes in free ranging wildlife, and promotes further surveillance for specific pathogens of potential conservation and zoonotic concern.

Copyright © 2020 Chang et al.