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真核細胞／真核生物／核生物の基本用語の使用について、アスガルド古細菌における真核生物のシグネチャーの発見による進化論的見解について、真核生物の新しい分類群名について
On the use of basic terms eukaryotic cell/eukaryotes/nucleated organisms, on evolutionary views challenged by the discovery of eukaryotic signatures in asgard archaea, and on a new taxon name for eukaryotes.
PMID: 32534168 DOI: 10.1016/j.biosystems.2020.104178.
抄録
最も広く受け入れられているエンドシンバイオシス理論は、細菌細胞が古細菌細胞に飲み込まれたとするものである。何十年もの間、この説は未確認の仮説とされてきましたが、最近になって、アスガルド古細菌の環境DNAにアクチン細胞骨格、小GTPases、ESCRT複合体などの真核生物のシグネチャーをコードしていることが間接的に証明されました。このように、真核細胞・真核生物・核生物の基本的な用語を再検討することは、共生理論のこの側面への関心が高まっていることを考えると、時宜を得ていると思われる。この論文では、これらの用語の不適切な適用を強調し、系統学と分類学に関してそれらの一貫性を求めています。また、以下のような古細菌類に代表される古細菌叢に対して、Caryosigniferaという新しい名称を提案している。(1)上記のDNAが示すアスガルド古細菌の代表的なもの、(2)絶滅した巻き込み古細菌の子孫、(3)現代の核生物（原生生物、藻類、植物、真菌、動物）における真核宿主細胞の系統。
The endosymbiosis theory most widely accepted variant surmises the engulfment of bacterial cell by archaeal cell. For decades, this scenario was reputed to be an unconfirmed hypothesis, and only recently it has obtained an indirect proof in Asgard archaea environmental DNA encoding eukaryotic signatures - actin cytoskeleton, small GTPases, and ESCRT complex. In view of growing interest to this aspect of the endosymbiosis theory, it seemed timely to revisit basic terms eukaryotic cell/eukaryotes/nucleated organisms. The article highlights inadequate applications of these terms, and seeks for their consistency with regard to phylogeny and taxonomy. Additionally, new name Caryosignifera is proposed for the archaeal phylum represented by: (1) several underexplored representatives of Asgard archaea manifested by above-mentioned DNA; (2) extant descendants of extinct engulfing archaea; (3) eukaryotic host cell lineages in modern nucleated organisms (protists, algae, plants, fungi, and animals).
Copyright © 2020. Published by Elsevier B.V.