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中国人患者におけるスターガード病に関連する新規バリアント
Novel variants associated with Stargardt disease in Chinese patients.
PMID: 32534057 DOI: 10.1016/j.gene.2020.144890.
抄録
目的:
スターガルト病（STGD）は小児期の遺伝性黄斑ジストロフィーの原因として最も頻度の高い疾患である。常染色体劣性または優性のSTGD患者では、ABCA4、ELOVL4、PROM1、BEST1、PRPH2遺伝子の変異が検出されている。本研究の目的は、中国のSTGD患者における新たな疾患関連変異を同定することである。
PURPOSE: Stargardt disease (STGD) is the most frequent cause of hereditary macular dystrophy in childhood. Variants in the ABCA4, ELOVL4, PROM1, BEST1, and PRPH2 genes have been detected in patients with autosomal recessive or dominant STGD. This study was aimed at identifying the novel disease-associated variants in Chinese patients with STGD.
方法:
本研究には、中国の 10 家族と散発性 STGD 患者 2 例（n=32）が登録された。全被験者が次世代シークエンシング（NGS）による遺伝子解析を受けた。これは、一般的な遺伝性眼症に関連する 792 の遺伝子のエクソンおよび非翻訳領域（UTR）を標的とした特別にカスタマイズされたキャプチャーパネルに基づいている。病原性の可能性を評価するためにバリアントを解析しました。
METHODS: Ten Chinese families and two sporadic cases with STGD (n = 32) were enrolled in the study. All subjects underwent genetic analysis with next-generation sequencing (NGS), which was based on a specially customized capture panel targeting exons and untranslated regions (UTRs) of 792 genes related to common hereditary ophthalmopathy. Variants were analyzed to assess possible pathogenicity.
結果:
中国人常染色体劣性STGD患者9家族において，11の病原性バリアントと3つの病原性バリアントを含む14のABCA4変異体が検出された．ABCA4の変異体c.4253+4C>Tは1つのde novo変異体として同定された。ABCA4の14の異なる変異体のうち、7つの新規変異体が発見された。また、PROM1の既知の変異体c.1117C>T (p.Arg373Cys)は、常染色体優性STGDを持つ1家族と1散発例でそれぞれ検出された。ELOVL4の新規ミスセンス変異c.59A>G (p.Asn20Ser)は、常染色体優性STGDを持つ散発性の1例で検出された。これらの新規変異体の潜在的な劇症効果は、集中的な解析により確認された。
RESULTS: Fourteen disease-associated variants of ABCA4 were detected in 9 Chinese families with autosomal recessive STGD, including 11 pathogenic variants and 3 likely pathogenic variants. Variant c.4253 + 4C > T in ABCA4 was identified as one de novo variant. Of the 14 distinct variants in ABCA4, 7 novel variants were found. In addition, one known variant of PROM1, c.1117C > T (p.Arg373Cys), was detected in one family and one sporadic case with autosomal dominant STGD, respectively. One novel missense variant of ELOVL4, c.59A > G (p.Asn20Ser), was found in one sporadic case with autosomal dominant STGD. The potential deleterious effects of these novel variants were confirmed through intensive analysis.
結論:
パネルベースのNGSにより、ABCA4とELOVL4を含むSTGDの原因となる2つの遺伝子に8つの新規疾患関連変異が同定された。今回の結果は、中国人STGD患者におけるこれら2つの遺伝子の変異スペクトルをさらに拡大したものである。ABCA4の1つのc.4253+4C>T変異は、de novo splicing variantとして同定された。
CONCLUSION: By panel-based NGS, 8 novel disease-associated variants are identified in two genes responsible for STGD, including ABCA4 and ELOVL4. Our results further extend the mutation spectrum of these two genes in Chinese patients with STGD. One ABCA4 c.4253 + 4C > T variant is identified as a de novo splicing variant.
Copyright © 2020. Published by Elsevier B.V.