日本語AIでPubMedを検索
逆転写ループ介在型等温増幅法による新規コロナウイルス/重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）の迅速検出
Rapid detection of novel coronavirus/Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) by reverse transcription-loop-mediated isothermal amplification.
PMID: 32530929 PMCID: PMC7292379. DOI: 10.1371/journal.pone.0234682.
抄録
新規コロナウイルス／重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2または2019-nCoV）、およびそのウイルスによって引き起こされるその後の疾患（コロナウイルス病2019またはCOVID-19）は、迅速な診断検査を必要とする新たな世界的な健康上の懸念である。定量的逆転写PCR（qRT-PCR）は現在、SARS-CoV-2検出のための標準であるが、逆転写ループ媒介等温増幅（RT-LAMP）は、ポイント・オブ・リスクでの迅速かつ安価なフィールドベースの検査を可能にする可能性がある。本研究の目的は、30～45分で完了できる迅速スクリーニング診断検査を開発することであった。模擬患者サンプルは、血清、尿、唾液、口咽頭スワブ、鼻咽頭スワブに SARS-CoV-2 の核酸配列の一部を加えてスパイクすることによって生成された。実際のCOVID-19患者から採取した鼻咽頭スワブから単離されたRNAも試験した。サンプルは、RT-LAMPおよび従来のqRT-PCRを用いて試験した。RT-LAMPの特異性は、他の関連するコロナウイルスに対しても検査して評価した。RT-LAMPは模擬患者サンプルと臨床検体の両方でSARS-CoV-2を特異的に検出した。この試験は30～45分で実施された。この方法は、曝露された個人のモニタリングに使用することができ、また、現場や潜在的な入国港でのスクリーニングの取り組みを支援する可能性があります。
Novel Corona virus/Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2 or 2019-nCoV), and the subsequent disease caused by the virus (coronavirus disease 2019 or COVID-19), is an emerging global health concern that requires a rapid diagnostic test. Quantitative reverse transcription PCR (qRT-PCR) is currently the standard for SARS-CoV-2 detection; however, Reverse Transcription Loop-Mediated Isothermal Amplification (RT-LAMP) may allow for faster and cheaper field based testing at point-of-risk. The objective of this study was to develop a rapid screening diagnostic test that could be completed in 30-45 minutes. Simulated patient samples were generated by spiking serum, urine, saliva, oropharyngeal swabs, and nasopharyngeal swabs with a portion of the SARS-CoV-2 nucleic sequence. RNA isolated from nasopharyngeal swabs collected from actual COVID-19 patients was also tested. The samples were tested using RT-LAMP as well as by conventional qRT-PCR. Specificity of the RT-LAMP was evaluated by also testing against other related coronaviruses. RT-LAMP specifically detected SARS-CoV-2 in both simulated patient samples and clinical specimens. This test was performed in 30-45 minutes. This approach could be used for monitoring of exposed individuals or potentially aid with screening efforts in the field and potential ports of entry.