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植物マイクロバイオーム。生態学から還元主義へ、そしてその先へ
The Plant Microbiome: From Ecology to Reductionism and Beyond.
PMID: 32530732 DOI: 10.1146/annurev-micro-022620-014327.
抄録
過去20年間の方法論の進歩は、植物マイクロバイオーム研究を推進し、この分野では100年以上前に提案されたアイデアを総合的に検証し、多くの新しい仮説を生み出すことを可能にしました。植物の生息地における微生物の分類と遺伝子の分布を研究することで、植物マイクロバイオータを形成する様々な生態学的・進化学的な力の重要性が明らかになってきた。特に、植物の生息地によって課せられた選択は、微生物相の多様性と構成を強く形成し、植物の免疫システムをナビゲートし、植物由来の資源を利用することに関連した微生物の適応を導く。還元主義的アプローチにより、植物免疫と植物マイクロバイオームの間の相互作用は実際には双方向性であり、植物、マイクロバイオータ、環境が複雑な化学的対話を形成し、植物マイクロバイオームをまとめて編成することが実証されている。植物マイクロバイオーム研究の次の段階では、自然環境と管理環境の両方における集合体と機能の一般的な理解を確立するために、生態学的アプローチと還元主義的アプローチを統合することが必要となる。第74巻の最終オンライン出版予定日は2020年9月8日です。修正後の予想については、http://www.annualreviews.org/page/journal/pubdates をご覧ください。
Methodological advances over the past two decades have propelled plant microbiome research, allowing the field to comprehensively test ideas proposed over a century ago and generate many new hypotheses. Studying the distribution of microbial taxa and genes across plant habitats has revealed the importance of various ecological and evolutionary forces shaping plant microbiota. In particular, selection imposed by plant habitats strongly shapes the diversity and composition of microbiota and leads to microbial adaptation associated with navigating the plant immune system and utilizing plant-derived resources. Reductionist approaches have demonstrated that the interaction between plant immunity and the plant microbiome is, in fact, bidirectional and that plants, microbiota, and the environment shape a complex chemical dialogue that collectively orchestrates the plant microbiome. The next stage in plant microbiome research will require the integration of ecological and reductionist approaches to establish a general understanding of the assembly and function in both natural and managed environments. Expected final online publication date for the , Volume 74 is September 8, 2020. Please see http://www.annualreviews.org/page/journal/pubdates for revised estimates.