調節性B細胞の転写メタ解析

Transcriptional meta-analysis of regulatory B cells.

• Florian Dubois
• Sophie Limou
• Mélanie Chesneau
• Nicolas Degauque
• Sophie Brouard
• Richard Danger

抄録

調節性B細胞（Breg）は、様々な病理学的状況で炎症を調節する能力を有しており、免疫調節のキープレイヤーとなっている。いくつかのメカニズムが記述されており、私たちは最近、腎移植に耐えうる腎移植患者において、GZMBを発現するBreg集団を同定しました。これらの細胞の生物学とメカニズムをさらに調べるために、私たちはこれらの細胞のRNAseqによるトランスクリプトーム解析を行い、ヒトとマウスの両方で公開されているBreg研究から得られた公開されているトランスクリプトームデータの最初の加重メタアナリシスを行いました。その結果、これらのBregに関連する2つの異なるユニークな転写シグネチャーを、それぞれ126個と93個の遺伝子から同定した。我々は、制御機能、増殖、転写因子をコードするタンパク質をコードする遺伝子に注目したが、ヒトとマウスを比較しても、共通のパターンを特定することはできなかった。以上のことから、ヒトとマウスでは、Bregの転写シグナルが異なる種に制限されていることが示唆された。

Regulatory B cells (Bregs) have the ability to regulate inflammation in various pathological situations, making them key players in immune regulation. Several mechanisms have been described and we recently identified a GZMB expressing Breg population in kidney transplanted patients who tolerate a kidney graft. To further investigate their biology and mechanisms, we conducted a transcriptomic analysis by RNAseq of these cells and we performed the first weighted meta-analysis of publicly available transcriptomic data from published Breg studies both in humans and mice. We identified two distinct and unique transcriptional signatures of 126 and 93 genes, respectively, associated with these Bregs. While we highlighted genes coding for proteins with potent involvement in regulatory functions, proliferation, and coding for transcription factors, the comparison between humans and mice did not allow identifying a common pattern. Thus, our results suggest distinct species-restricted Breg transcriptional signatures in humans and mice.

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