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イランにおける臨床的に関連するフザリウム種の系統解析
Phylogenetic Analysis of Clinically Relevant Fusarium Species in Iran.
PMID: 32506392 DOI: 10.1007/s11046-020-00460-x.
抄録
フザリウム属の菌類は、主要な植物病原体としてよく知られているが、広範囲のヒト感染症の原因にもなっている。2014年から2017年の間に採取された63の臨床分離株を、TEF1遺伝子の一部をバーコーディングマーカーとして用いて同定した。Fusarium fujikuroi種複合体(FFSC、n=41、65%)が優占的な病因菌であり、F. solani種複合体(FSSC、n=14、22%)、F. oxysporum種複合体(FOSC、n=7、11%)が続いた。また,F. lateritium種複合体(FLSC,n=1,1.5%)に属する菌株が1株あった.最終的な同定のために,各種複合体の型株を含む系統樹を作成した.フザリウム症のほとんどの症例は爪の感染(n=38, 60.3%)によるものであり,次いで角膜炎(n=22, 34%)であった.フザリウム感染症は,アゾール系薬剤に対する抵抗性が高いため,治療が困難であるが,病因菌を正確かつ迅速に同定することで,感染症の管理が容易になる可能性がある.本研究では,イランの臨床的なFusarium spp.について初めて系統的な研究を行った.
Fungi of the genus Fusarium are well known as major plant pathogens but also cause a broad spectrum of human infections. Sixty-three clinical isolates, collected during 2014-2017, were identified using a part of the TEF1 gene as barcoding marker. Fusarium fujikuroi species complex (FFSC, n = 41, 65%) showed to be the dominant etiological agent, followed by F. solani species complex (FSSC, n = 14, 22%) and F. oxysporum species complex (FOSC, n = 7, 11%). There was one strain belonging to F. lateritium species complex (FLSC, n = 1, 1.5%). For final identification, a phylogenetic tree was constructed including the type strains of each species complex. Most cases of fusariosis were due to nail infection (n = 38, 60.3%), followed by keratitis (n = 22, 34%). Fusarium infections are difficult to be treated due to their intrinsic resistance to different azoles; however, accurate and fast identification of etiological agents may enhance management of the infection. We present the first phylogenetic study on clinical Fusarium spp. from Iran.