塩湖堆積物から単離された sp

sp. nov., isolated from salt-lake sediment.

• Hong Ming
• Wei-Li Ji
• Meng Li
• Zhuo-Li Zhao
• Li-Jiao Cheng
• Ming-Ming Niu
• Ling-Yu Zhang
• Yan Wang
• Guo-Xing Nie

抄録

中国山西省雲城市で採取した塩湖堆積物から，CFH 90008と命名された細菌株が分離された．菌株CFH 90008はグラム染色陰性で，厳密には好気性で，運動性で側方鞭毛があり，棒状であった．コロニーは黄色，円形，平滑であった。16S rRNAの遺伝子配列をもとに系統解析を行ったところ，CFH 90008株は属に属し，DQD2-30（98.6"Zs_200A"%），LCB169（98.5"Zs_200A"%），FB2（98.1"Zs_200A"%），AIR-2（98.0"Zs_200A"%）と最も高い配列類似性を示した。10〜50℃、pH6.0〜9.0、NaCl濃度1.0〜12.0"Zs_200A"%(w/v)で良好な生育が観察された。主なキノンはQ9であった。主要な脂肪酸(>10"Zs_200A"%)はCω7、C、Cω7であった。株CFH 90008のゲノムは4.36Mbpで、ゲノムDNAのG+C含量は66.7mol%であった。平均ヌクレオチド同一性の低さ、DNA-DNAハイブリダイゼーションの結果、化学的タキソノミック特性、および生理学的特性の違いから、菌株CFH 90008は属のどの種にも分類できなかった。そのため，新種としてsp.nov.を提案した。型株は CFH 90008 (=DSM 103220=KCTC 52281)である。

A bacteria strain, designated CFH 90008, was isolated from a salt lake sediment sample collected from Yuncheng city, Shanxi Province, PR China. Strain CFH 90008 was Gram-stain-negative, strictly aerobic, motile with lateral flagella and rod-shaped. Colonies were yellow, circular and smooth. Phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene sequences indicated that strain CFH 90008 belonged to the genus , showing highest sequence similarity to DQD2-30 (98.6 %), LCB169 (98.5 %), FB2 (98.1 %) and AIR-2 (98.0 %). Good growth was observed at 10-50 °C, pH 6.0-9.0 and with NaCl concentration from 1.0 to 12.0 % (w/v). The predominant quinone was Q9. The major fatty acid (>10 %) was C ω7, C and C ω7. The genome of strain CFH 90008 was 4.36 Mbp with a genomic DNA G+C content of 66.7 mol%. Based on low average nucleotide identity and DNA-DNAhybridization results, chemotaxonomic characteristics, and differential physiological properties, strain CFH 90008 could not be classified into any recognized species of the genus . Therefore, a new species, for which the name sp. nov. is proposed. The type strain is CFH 90008 (=DSM 103220=KCTC 52281).