sp. nov.は黄海の潮間帯砂から分離された海洋細菌である

sp. nov., a marine bacterium isolated from intertidal sand of the Yellow Sea.

• Ang Liu
• Yan-Jiao Zhang
• De-Kun Liu
• Xiu-Zhen Li

抄録

中国黄海の潮間帯で採取した砂地から，棒状でグラム染色陰性の新規菌RZ05株を分離した。16S rRNAの遺伝子配列をもとに系統解析を行った結果、RZ05株は同属に属し、KCTC 22021（97.8"Zs_200A"%）との配列類似度が最も高く、KCTC 52191（97.2"Zs_200A"%）に続いていることが明らかになった。この菌株の細胞は好気性で、酸化酵素およびカタラーゼ陽性で、滑空運動性があり、黄色のコロニーを形成していることが観察された。成長は、7〜40℃（最適、30℃）、pH6.5〜9.5（最適、pH7.0）、0.5〜6"Zs_200A"％（最適、2"Zs_200A"％）のNaClで行われた。その極性脂質プロファイルは、ホスファチジルエタノールアミン、2つの未同定の糖脂質、1つの未同定のアミノ脂質および4つの未同定の脂質を含んでいた。主要な細胞性脂肪酸は、iso-C、iso-C G、iso-C 3-OH、iso-C 3-OH、summed feature 9（10-methyl C/iso-Cω9）およびsummed feature 3（iso-C 2-OH/Cω7/Cω6）であった。呼吸性キノンはメナキノン６（ＭＫ-６）のみであった。株RZ05のゲノムは4.65Mbp、G+C含量は38.9mol%であった。株RZ05と最も近縁の型株KCTC 22021との間の平均ヌクレオチド同一性およびDNA-DNAハイブリダイゼーション値は、それぞれ80.3および26.3"Zs_200A""Zs_200A"%であった。系統解析，表現型解析および化学軸索学的解析の結果，RZ05株は同属の新種であることが示唆され，sp.型はRZ05株（=KCTC 62834=MCCC 1K03617）である。

A novel rod-shaped and Gram-stain-negative bacterium, designated strain RZ05, was isolated from a sand sample collected from the intertidal zone of the Yellow Sea, PR China. Results of phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences revealed that strain RZ05 clusters within the genus , a member of the family , and has the highest sequence similarity to KCTC 22021 (97.8 %), followed by KCTC 52191 (97.2 %). Cells of this strain were observed to be aerobic, oxidase- and catalase-positive, motile by gliding and formed yellow colonies. Growth occurred at 7-40 °C (optimum, 30 °C), at pH 6.5-9.5 (optimum, pH 7.0) and with 0.5-6 % (optimum, 2 %) NaCl. Its polar lipid profile included phosphatidylethanolamine, two unidentified glycolipids, one unidentified aminolipid and four unidentified lipids. The major cellular fatty acids were iso-C, iso-C G, iso-C 3-OH, iso-C 3-OH, iso-C 3-OH, summed feature 9 (10-methyl C/iso-Cω9) and summed feature 3 (iso-C 2-OH/Cω7/Cω6). The only respiratory quinone was menaquinone 6 (MK-6). The genome of strain RZ05 was 4.65 Mbp with a G+C content of 38.9 mol%. The average nucleotide identity and DNA-DNA hybridization values between strain RZ05 and its most closely related type strain KCTC 22021 were 80.3 and 26.3  %, respectively. The results of phylogenetic, phenotypic and chemotaxonomic analyses indicated that strain RZ05 represents a novel species of the genus , for which the name sp. nov. is proposed. The type strain is RZ05 (=KCTC 62834=MCCC 1K03617).