sp.nov.は東シナ海の堆積物から分離され、 comb.nov.とcomb.nov.として再分類された

sp. nov., isolated from sediment of the East China Sea, and reclassification of as comb. nov. and as comb. nov.

• Qian Wang
• Sheng-Dong Cai
• Jie Liu
• De-Chao Zhang

抄録

グラム株陰性、棒状、多孔性嫌気性、非増殖性の細菌株S1-10を海底堆積物から分離した。S1-10は、4-42℃（最適には30-35℃）、pH7.0-10（最適にはpH9）、0.5-8"Zs_200A"% (w/v) NaClの存在下で増殖した。16S rRNA遺伝子配列に基づく系統解析の結果、S1-10株は属縁株であり、8-1b株と最も高い16S rRNA遺伝子配列類似度（97.7％）を有していた。細胞性脂肪酸はiso-Cとanteiso-Cが優勢であった。主な呼吸器キノンはメナキノン6（MK-6）であった。株S1-10のゲノムDNA G+C含量は34.6mol%であった。株S1-10の極性脂質プロファイルは、ホスファチジルエタノールアミン、アミノ脂質2種、糖脂質2種、ホスホグリコリプイド1種、および未同定の極性脂質3種を含んでいた。また、S1-10株とCGMCC 1.11023株との間のDNA-DNAハイブリダイゼーション（DDH）および平均ヌクレオチド同一性（ANI）の最大値は、それぞれ15.4および75.7"Zs_200A"%であった。表現型解析、系統解析、DDH解析、平均ヌクレオチド同一性（ANI）解析の結果から、S1-10株は同属の新種の代表株であることが明らかになった。(type strain S1-10=CGMCC 1.12579=JCM 19789)と命名した。また，sp. nov.を属に移して，それぞれcomm. nov.とcomm. nov.と命名することを提案する。菌株はMYP2-2(="Zs_200A"KCTC 62141="Zs_200A"NBRC 113025)、菌株はD-24(=KCTC 42708=DSM 101732)である。

The Gram-strain-negative, rod-shaped, facultatively anaerobic, non-motile bacterial strain, designated S1-10, was isolated from marine sediment. Strain S1-10 grew at 4-42 °C (optimally at 30-35 °C), at pH 7.0-10 (optimally at pH 9) and in the presence of 0.5-8 % (w/v) NaCl. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences showed that strain S1-10 was related to the genus and had highest 16S rRNA gene sequence similarity to 8-1b (97.7%). The predominant cellular fatty acids were iso-C and anteiso-C. The main respiratory quinone was menaquinone 6 (MK-6). The genomic DNA G+C content of strain S1-10 was 34.6 mol%. The polar lipid profile of strain S1-10 contained phosphatidylethanolamine, two aminolipids, two glycolipids, one phosphoglycolipid and three unidentified polar lipids. In addition, the maximum values of DNA-DNA hybridization (DDH) and average nucleotide identity (ANI) between strain S1-10 and CGMCC 1.11023 were 15.4 and 75.7 %, respectively. Combined data from phenotypic, phylogenetic, DDH and ANI analyses demonstrated that strain S1-10 is the representative of a novel species of the genus , for which we propose the name sp. nov. (type strain S1-10=CGMCC 1.12579=JCM 19789). We also propose that and should be transferred into genus and be named comb. nov. and comb. nov., respectively. The type strain of comb. nov. is MYP2-2 (= KCTC 62141= NBRC 113025) and the type strain of comb. nov. is D-24 (=KCTC 42708=DSM 101732).