青海チベット高原の葉から単離されたsp

sp. nov., isolated from leaves of on the Qinghai-Tibet Plateau.

• Sihui Zhang
• Xiaoxia Wang
• Jing Yang
• Shan Lu
• Xin-He Lai
• Dong Jin
• Yuyuan Huang
• Wentao Zhu
• Junqin Li
• Ji Pu
• Ying Huang
• Zhi Tian
• Kui Dong
• Gui Zhang
• Wenjing Lei
• Suping Wang
• Jianguo Xu

抄録

グラム染色陽性の不規則な棒状放線菌S-1144と4053を中国青海チベット高原から分離した。細胞は好気性、カタラーゼ陽性、酸化酵素陰性であった。Reasoner's 2A寒天上のコロニーは、2日間の培養後、淡黄色、円形、光沢があり、滑らかで凸状であった。分離株は25℃、pH7.5、0"Zs_200A"% (w/v) NaClで最適に増殖した。多相解析の結果，S-1144株は本属に属し，系統的にはDSM 103718（98.4"Zs_200A"%），DSM 23986（98.2%），DSM 11054（97.8"Zs_200A"%）が近縁であることが示された。S-1144株のゲノムは、デジタルDNA-DNAハイブリダイゼーションで70"Zs_200A"%未満、95-96"Zs_200A"%未満の平均ヌクレオチド同一性値を上記参照株と比較して示した。S-1144株のDNA G+C含量は73.5mol%であった。MK-8(H)が優勢な呼吸性キノン(96.0"Zs_200A"%)であり、llLL-2,6-ジアミノピメル酸が細胞壁ペプチドグリカンの診断用ジアミノ酸であった。株S-1144の極性脂質プロファイルは、ジホスファチジルグリセロール、ホスファチジルグリセロール、未同定リン脂質3種、未同定糖脂質1種、未同定脂質1種から構成されていた。主な細胞性脂肪酸は、iso-C、C8、C、C9であった。得られたデータに基づいて，S-1144株は同属の新種であり，sp.nov.と命名された。型株はS-1144（=CGMCC 4.7568=JCM 33469）である。

Two novel Gram-stain-positive, irregular rod-shaped actinomycetes, S-1144 and 4053, were isolated from leaves of on the Qinghai-Tibet Plateau, PR China. Cells were aerobic, catalase-positive and oxidase-negative. Colonies on Reasoner's 2A agar were light yellow, circular, shiny, smooth and convex after 2 days of incubation. The isolates grew optimally at 25 °C, pH 7.5 and with 0 % (w/v) NaCl. The results of polyphasic analyses indicated that strain S-1144 belonged to the genus and its close phylogenetic neighbours (16S rRNA gene sequence similarity) were DSM 103718 (98.4 %), DSM 23986 (98.2%) and DSM 11054 (97.8 %). The genome of strain S-1144 showed less than 70 % digital DNA-DNA hybridization and < 95-96 % average nucleotide identity values to the above reference strains. The DNA G+C content of strain S-1144 was 73.5 mol%. MK-8(H) was the predominant respiratory quinone (96.0 %) and llLL-2,6-diaminopimelic acid was the diagnostic diamino acid in the cell-wall peptidoglycan. The polar lipid profile of strain S-1144 consisted of diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol, three unidentified phospholipids, one unidentified glycolipid and one unidentified lipid. The major cellular fatty acids were iso-C, C8, C and C9. On the basis of obtained data, strain S-1144 represented a novel species of the genus , for which the name sp. nov. is proposed. The type strain is S-1144 (=CGMCC 4.7568=JCM 33469).