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マレーシア・ボルネオ島コタキナバルの幼稚園で発生した新興ノロウイルスGII.2P16による胃腸炎
An outbreak of gastroenteritis by emerging norovirus GII.2[P16] in a kindergarten in Kota Kinabalu, Malaysian Borneo.
PMID: 32346119 PMCID: PMC7189370. DOI: 10.1038/s41598-020-64148-4.
抄録
幼稚園での下痢の発生は報告されておらず、発展途上国では気付かれないことが多い。病因をよりよく理解するために、本研究はマレーシアのサバ州にある幼稚園で下痢が発生した際に実施された。発生調査は標準的な手順に従って実施された。その結果,園児34名(36.5%),教員4名(30.8%)が胃腸炎を発症した.7名の児童と13名の教員の便を採取し,ロタウイルスとノロウイルスの検査を行った.調査中に便サンプルが採取され,コールドチェーンで検査室に送られた.検体はロタウイルス酵素免疫吸着法とノロウイルスの逆転写PCR法で検査された.全てのサンプルはロタウイルスに対して陰性であったが、ノロウイルスに対しては陽性であった。ノロウイルスの遺伝子グループと遺伝子型を決定するために,アンプリコンのヌクレオチド配列決定を行った.発生したノロウイルスはすべて遺伝子型GII.2[16]であった.菌株の関連性を調べるために,隣接結合法を用いて系統解析を行った.その結果,これらの株は中国や日本のGII.2[P16]ノロウイルスと系統的に高い関連性を示した.本研究により,幼稚園で発生した下痢症の原因が,東アジアやヨーロッパで出現しつつあるGII.2[P16]ノロウイルスによるものであることが明らかになった.
Outbreaks of diarrhea in kindergartens are underreported and frequently go unnoticed in developing countries. To better understand the etiology this study was performed during an outbreak of diarrhea in a kindergarten in Sabah, Malaysia. Outbreak investigation was performed according to the standard procedures. In this outbreak a total of 34 (36.5%) children and 4 (30.8%) teachers suffered from gastroenteritis. Stool samples from seven children and 13 teachers were tested for rotavirus and norovirus. During the investigation stool samples were collected and sent in cold chain to the laboratory. The samples were subjected to rotavirus enzyme linked immunosorbent assay, and reverse transcription PCR for norovirus. All samples were negative for rotavirus but positive for norovirus. To determine the genogroup and genotype of norovirus, nucleotide sequencing of the amplicons was performed. All norovirus from the outbreak was of genotype GII.2[16]. To determine the relatedness of the strains phylogenetic analysis was done using neighbor-joining method. Phylogenetically these strains were highly related to GII.2[P16] noroviruses from China and Japan. This study provided evidence that a diarrheal outbreak in a kindergarten was caused by GII.2[P16] norovirus which is an emerging strain in East Asia and Europe.