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Viruses.2020 Apr;12(4). E441. doi: 10.3390/v12040441.Epub 2020-04-14.

ブルガリアにおけるHIV-1サブタイプBのサブ流行の分子疫学

Molecular Epidemiology of the HIV-1 Subtype B Sub-Epidemic in Bulgaria.

  • Ivailo Alexiev
  • Ellsworth M Campbell
  • Sergey Knyazev
  • Yi Pan
  • Lyubomira Grigorova
  • Reneta Dimitrova
  • Aleksandra Partsuneva
  • Anna Gancheva
  • Asya Kostadinova
  • Carole Seguin-Devaux
  • William M Switzer
PMID: 32295123 PMCID: PMC7232140. DOI: 10.3390/v12040441.

抄録

ブルガリアではHIV-1サブタイプBが優勢であるが,その起源や感染性など,これらの感染症の分子疫学についてはほとんど知られていない.我々は、1988年から2018年の間にHIV/AIDSと診断された人から収集した663のHIV-1ポリメラーゼ()配列と関連する疫学データを組み合わせて解析することにより、系統力学的アプローチを用いて、ブルガリアにおけるこの亜流行の理解を深めた。1.5%の遺伝的距離閾値(1.5%)でネットワーク解析を行ったところ、主に男性と性交渉をする男性(MSM)と男性異性愛者(HET)で構成されるいくつかの大規模な系統群を発見した。しかし、より最近の感染を識別するために使用されるd = 0.5%では、最大のクラスタは解離してサイズが小さくなりました。女性のHETと他の感染リスクを持つ人の大多数は、ネットワーク内の一人組またはペアであった。公開されているグローバル配列を用いてブルガリアの配列を系統解析した結果、サブタイプBはイスラエルやヨーロッパの国々を含む複数の国からブルガリアに持ち込まれた可能性が高いことが示されました。我々の知見は、1988年以降、サブタイプBがブルガリアに複数回導入され、その後、MSMや非公表MSMの間で急速に感染が拡大したことを示している。このようなハイリスクな行動は、0.5%の大規模なクラスターで証明されているように、ブルガリアではサブタイプBの感染を拡大させ続けている。我々の研究では、比較的低いレベルの抗レトロウイルス薬耐性が観察された。予防戦略には、検査の増加、ケアや治療へのリンク、MSMコミュニティへのアウトリーチの拡大などが引き続き含まれるべきである。

HIV-1 subtype B is the predominant strain in Bulgaria, yet little is known about the molecular epidemiology of these infections, including its origin and transmissibility. We used a phylodynamics approach by combining and analyzing 663 HIV-1 polymerase () sequences collected from persons diagnosed with HIV/AIDS between 1988-2018 and associated epidemiologic data to better understand this sub-epidemic in Bulgaria. Using network analyses at a 1.5% genetic distance threshold ( we found several large phylogenetic clusters composed mostly of men who have sex with men (MSM) and male heterosexuals (HET). However, at d = 0.5%, used to identify more recent transmission, the largest clusters dissociated to become smaller in size. The majority of female HET and persons with other transmission risks were singletons or pairs in the network. Phylogenetic analysis of the Bulgarian sequences with publicly available global sequences showed that subtype B was likely introduced into Bulgaria from multiple countries, including Israel and several European countries. Our findings indicate that subtype B was introduced into Bulgaria multiple times since 1988 and then infections rapidly spread among MSM and non-disclosed MSM. These high-risk behaviors continue to spread subtype B infection in Bulgaria as evidenced by the large clusters at = 0.5%. Relatively low levels of antiretroviral drug resistance were observed in our study. Prevention strategies should continue to include increased testing and linkage to care and treatment, as well as expanded outreach to the MSM communities.