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COVID-19ウイルス由来RNA依存性RNAポリメラーゼの構造
Structure of the RNA-dependent RNA polymerase from COVID-19 virus.
PMID: 32277040 PMCID: PMC7164392. DOI: 10.1126/science.abb7498.
抄録
新型コロナウイルス[重症急性呼吸器症候群-コロナウイルス2（SARS-CoV-2）]の流行により、世界的なコロナウイルス疾患2019（COVID-19）のパンデミックが発生し、世界中で数万人の感染者と数千人の死亡者を出している。RNA依存性RNAポリメラーゼ[(RdRp)、別名nsp12]は、コロナウイルスの複製・転写機械の中心的な構成要素であり、抗ウイルス薬であるレムデシビルの主要な標的であると考えられている。本研究では、COVID-19ウイルス全長nsp12と補因子nsp7、nsp8との複合体の低温電子顕微鏡構造を2.9オングストローム分解能で解析した。ウイルスポリメラーゼファミリーのポリメラーゼコアの保存された構造に加えて、nsp12はそのN末端に新たに同定されたβヘアピンドメインを持っていた。比較解析モデルは、レムデシビルがどのようにこのポリメラーゼに結合するかを示している。この構造は、ウイルスRdRpを標的とした新しい抗ウイルス治療薬の設計の基礎を提供します。
A novel coronavirus [severe acute respiratory syndrome-coronavirus 2 (SARS-CoV-2)] outbreak has caused a global coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic, resulting in tens of thousands of infections and thousands of deaths worldwide. The RNA-dependent RNA polymerase [(RdRp), also named nsp12] is the central component of coronaviral replication and transcription machinery, and it appears to be a primary target for the antiviral drug remdesivir. We report the cryo-electron microscopy structure of COVID-19 virus full-length nsp12 in complex with cofactors nsp7 and nsp8 at 2.9-angstrom resolution. In addition to the conserved architecture of the polymerase core of the viral polymerase family, nsp12 possesses a newly identified β-hairpin domain at its N terminus. A comparative analysis model shows how remdesivir binds to this polymerase. The structure provides a basis for the design of new antiviral therapeutics that target viral RdRp.
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