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マラヤパンゴリンにおけるSARS-CoV-2関連コロナウイルスの同定
Identifying SARS-CoV-2-related coronaviruses in Malayan pangolins.
PMID: 32218527 DOI: 10.1038/s41586-020-2169-0.
抄録
中国をはじめ世界中でウイルス性肺炎の流行が続いていますが、これは新しいコロナウイルスである SARS-CoV-2 に関連しています。このアウトブレイクは、野生動物の販売が人獣共通感染症の感染源となっている可能性がある中国・武漢の水産物市場と暫定的に関連していると考えられています。コウモリは SARS-CoV-2 のリザーバー宿主である可能性が高いが、ヒトへの感染を促進した可能性のある中間宿主の正体は不明である。ここでは、中国南部での密輸対策作戦で押収されたマラヤパンゴリン（Manis javanica）から SARS-CoV-2 関連のコロナウイルスを同定したことを報告する。メタゲノム解析の結果、パンゴリン関連コロナウイルスはSARS-CoV-2関連コロナウイルスの2つの亜系統に属することが明らかになり、そのうちの1つはSARS-CoV-2の受容体結合ドメインに強い類似性を示すものであった。パンゴリンコロナウイルスの複数の系統の発見とSARS-CoV-2との類似性は、パンゴリンが新しいコロナウイルスの出現の宿主となる可能性があることを示唆しており、人獣共通感染を防ぐために湿地市場から排除すべきであることを示唆している。
The ongoing outbreak of viral pneumonia in China and across the world is associated with a new coronavirus, SARS-CoV-2. This outbreak has been tentatively associated with a seafood market in Wuhan, China, where the sale of wild animals may be the source of zoonotic infection. Although bats are probable reservoir hosts for SARS-CoV-2, the identity of any intermediate host that may have facilitated transfer to humans is unknown. Here we report the identification of SARS-CoV-2-related coronaviruses in Malayan pangolins (Manis javanica) seized in anti-smuggling operations in southern China. Metagenomic sequencing identified pangolin-associated coronaviruses that belong to two sub-lineages of SARS-CoV-2-related coronaviruses, including one that exhibits strong similarity in the receptor-binding domain to SARS-CoV-2. The discovery of multiple lineages of pangolin coronavirus and their similarity to SARS-CoV-2 suggests that pangolins should be considered as possible hosts in the emergence of new coronaviruses and should be removed from wet markets to prevent zoonotic transmission.