ペルー、アンカシュ地方の農村部で発生する新しい病原体、Bartonella ancashensisの全ゲノム解析

Whole-Genome Analysis of Bartonella ancashensis, a Novel Pathogen Causing Verruga Peruana, Rural Ancash Region, Peru.

• Kristin E Mullins
• Jun Hang
• Robert J Clifford
• Fatma Onmus-Leone
• Yu Yang
• Ju Jiang
• Mariana Leguia
• Matthew R Kasper
• Ciro Maguina
• Emil P Lesho
• Richard G Jarman
• Allen Richards
• David Blazes

抄録

Bartonella属には40種以上の種が含まれており、これらのBartonella種のうち、ヒトの病気に関与するものが増えてきています。そのような病原体の一つがBartonella ancashensisであり，ペルーのカラズに住む2人の患者の血液から分離されたBartonella ancashensisは，バルテロネラ症の治療の臨床試験中に分離されました．3つのB. ancashensis株を全ゲノム制限マッピングとハイスループットパイロシーケンシングを用いて解析した。その結果，B. ancashensisは現代および古代のBartonella種の系統に見られる特徴を持ち，B. bacilliformisとより近縁であることが明らかになった．B. ancashensis と B. bacilliformis の間の発散は、既知のバルテロネラの遺伝的系統の間で見られるものよりもはるかに大きい。さらに、B. ancashensisは、B. bacilliformisには存在しないIV型分泌系タンパク質を含んでいます。全ゲノム解析の結果、B. ancashensisはB. bacilliformisに系統的に関連した別個のバルテロネラ系統である可能性が示唆された。

The genus Bartonella contains >40 species, and an increasing number of these Bartonella species are being implicated in human disease. One such pathogen is Bartonella ancashensis, which was isolated in blood samples from 2 patients living in Caraz, Peru, during a clinical trial of treatment for bartonellosis. Three B. ancashensis strains were analyzed by using whole-genome restriction mapping and high-throughput pyrosequencing. Genome-wide comparative analysis of Bartonella species showed that B. ancashensis has features seen in modern and ancient lineages of Bartonella species and is more related to B. bacilliformis. The divergence between B. ancashensis and B. bacilliformis is much greater than what is seen between known Bartonella genetic lineages. In addition, B. ancashensis contains type IV secretion system proteins, which are not present in B. bacilliformis. Whole-genome analysis indicates that B. ancashensis might represent a distinct Bartonella lineage phylogenetically related to B. bacilliformis.