口腔扁平上皮癌における次世代シークエンスに基づく唾液バイオマーカー

Next generation sequencing-based salivary biomarkers in oral squamous cell carcinoma.

抄録

次世代シーケンサー（NGS）を用いたタンパク質研究により、唾液や上皮組織から疾患特異的なバイオマーカーの候補を選択することが最近可能になりました。口腔扁平上皮癌（OSCC）の早期診断は、有効なOSCCバイオマーカーと効率的な分子検証法がないため、これまで不可能ではないにしても、困難であった。本研究の目的は、がん研究におけるNGSの応用の進歩を要約し、OSCCのスクリーニングおよび診断プログラムにおけるNGSに基づく研究のための潜在的なプロテオームおよびゲノム唾液バイオマーカーを提案することであった。NGSの定義と使用、唾液バイオマーカーとOSCC、NGSベースの手法を用いた現在のバイオマーカー、NGSを用いたOSCCにおける唾液バイオマーカー候補の4つのカテゴリーについて検討した。

Selection of potential disease-specific biomarkers from saliva or epithelial tissues through next generation sequencing (NGS)-based protein studies has recently become possible. The early diagnosis of oral squamous cell carcinoma (OSCC) has been difficult, if not impossible, until now due to the lack of an effective OSCC biomarker and efficient molecular validation method. The aim of this study was to summarize the advances in the application of NGS in cancer research and to propose potential proteomic and genomic saliva biomarkers for NGS-based study in OSCC screening and diagnosis programs. We have reviewed four categories including definitions and use of NGS, salivary biomarkers and OSCC, current biomarkers using the NGS-based technique, and potential salivary biomarker candidates in OSCC using NGS.