ARMCXファミリー遺伝子発現解析と胃がん患者の臨床予後予測のための予後バイオマーカーの可能性

ARMCX Family Gene Expression Analysis and Potential Prognostic Biomarkers for Prediction of Clinical Outcome in Patients with Gastric Carcinoma.

• TingAn Wang
• HuaGe Zhong
• YuZhou Qin
• WeiYuan Wei
• Zhao Li
• MingWei Huang
• XiaoLing Luo

抄録

アルマジロ遺伝子サブファミリー（ARMCX1-6）は、核輸送、細胞接続、転写活性化に関わるタンパク質間相互作用を制御することが知られています。また、ARMCXは、発がんや腫瘍の進行にも関与する細胞経路にシグナルを送っていることが知られています。しかし、ARMCXサブファミリーと胃がんとの関連性についてはほとんど知られていない。本研究では、ARMCX サブファミリーの mRNA 発現レベルと胃癌（GC）の予後との関連を検討した。TCGAデータベースから胃がん患者351名のデータを検索した。GCにおけるARMCX遺伝子の予後予測値とその基盤となるメカニズムを探るために、生存期間解析と遺伝子セット濃縮解析を行った。多変量解析の結果、ARMCX1（調整値0.006、HR値0.620、CI値0.440～0.874）とARMCX2（調整値0.005、HR値0.610、95%CI値0.432～0.861）の低発現は、それぞれ好ましい全生存期間（OS）と関連していることが明らかになった。共同効果解析では、ARMCX1とARMCX2の低レベル発現の組み合わせが好ましい全生存期間（OS）と相関していた（調整済みP = 0.003、HR = 0.563、95%CI = 0.384-0.825）。ARMCX1およびARMCX2は、WNTおよびNF-κB経路、細胞周期、アポトーシス、RNA修飾、DNA複製、および損傷応答を含む生物学的プロセスに関与していた。これらの結果は、ARMCXサブファミリーのmRNA発現レベルがGCの予後マーカーとなる可能性を示唆している。

Armadillo gene subfamily members (ARMCX1-6) are well-known to regulate protein-protein interaction involved in nuclear transport, cellular connection, and transcription activation. Moreover, ARMCX signals on cell pathways also implicated in carcinogenesis and tumor progression. However, little is known about the associations of the ARMCX subfamily members with gastric carcinoma. This study investigated the prognostic value of ARMCX subfamily mRNA expression levels with the prognosis of gastric carcinoma (GC). We retrieved the data of a total of 351 GC patients from TCGA database. Survival and gene set enrichment analyses were employed to explore the predictive value and underlying mechanism of ARMCX genes in GC. The multivariate survival analysis revealed that individually low expressions of ARMCX1 (adjusted = 0.006, HR = 0.620, CI = 0.440 - 0.874) and ARMCX2 (adjusted = 0.005, HR = 0.610, 95%CI = 0.432-0.861) were related to preferable overall survival (OS). The joint-effects analysis shown that combinations of low level expression of ARMCX1 and ARMCX2 were correlated with favorable OS (adjusted P = 0.003, HR = 0.563, 95%CI = 0.384-0.825). ARMCX1 and ARMCX2 were implicated in WNT and NF-kappaB pathways, and biological processes including cell cycle, apoptosis, RNA modification, DNA replication, and damage response. Our results suggest that mRNA expression levels of ARMCX subfamily are potential prognostic markers of GC.

Copyright © 2020 TingAn Wang et al.