ポルシンサーコウイルス3型（PCV3）の検出に最適化されたリアルタイム蛍光PCR法を開発した

Optimized real-time fluorescence PCR assay for the detection of porcine Circovirus type 3 (PCV3).

• Lin Yuan
• Yingyi Liu
• Yana Chen
• Xiaoxue Gu
• Hao Dong
• Shuo Zhang
• Tao Han
• Zhi Zhou
• Xiaohui Song
• Chuanbin Wang

抄録

背景:

ポルシンサーコウイルス3型（PCV3）は、世界的に流行している新興のブタウイルスである。PCV3のDNA配列が保存されていることから、分子生物学的アッセイにおいて優れた性能を示しています。

BACKGROUND: Porcine circovirus type 3 (PCV3) has been an emerging porcine virus spread around the world. The conserved DNA sequence of PCV3 enabled good performance in molecular biological assays.

結果:

本研究では、PCV3を検出するためのリアルタイム蛍光PCR法を開発した。PCV3 の Capsid ゲノム内の保存領域を選択し、プライマーペアとプローブの設計を行った。最適化した後、高感度（10コピー/μL）、高特異性（他のブタウイルスや一般細菌との交差反応がない）を有するプライマーペアとプローブをスクリーニングした。また、本法を110検体の臨床検体検出に適用し、これまでに報告されている他のPCR法やリアルタイムPCR法との比較を行ったところ、より高い検出率が得られた。この方法の方が高い検出率が得られた。

RESULT: In this study, we developed a real-time fluorescence PCR assay for the detection of PCV3. The conserved region within Capsid genome of PCV3 was selected for the design of primer pairs and probes. After optimizing, a primer pair and probe was screened, providing high sensitivity (10 copies/μL) and specificity (no cross reaction with other porcine viruses or common bacterium). In addition, this method was applied in the detection of 110 clinical samples, and the performance was compared with other previously reported PCR and real-time PCR methods. This method provided higher detection rate.

結論:

PCV3 を検出するためのリアルタイム蛍光 PCR アッセイを開発した。

CONCLUSION: A real-time fluorescence PCR assay has been developed for the detection of PCV3, with high sensitivity and specificity, exhibiting good performance in detecting clinical samples.