次世代シークエンシングにより得られた完全マイトゲノム配列を用いた日本の8,300年前の縄文人遺体の研究

A study of 8,300-year-old Jomon human remains in Japan using complete mitogenome sequences obtained by next-generation sequencing.

• Fuzuki Mizuno
• Yasuhiro Taniguchi
• Osamu Kondo
• Michiko Hayashi
• Kunihiko Kurosaki
• Shintaroh Ueda

抄録

古代ヒト遺体はミトコンドリアDNA（mtDNA）のハプログループに割り当てられている。本研究では、興味のある古代DNAのヌクレオチド配列を効率的に深く信頼性の高いものにするために、ターゲットエンリッチメントに続いて次世代シークエンシング(NGS)を行いました。縄文時代初期の伊耶井岩壁遺跡から出土した3つのヒト遺体について、ミトコンドリアゲノム（マイトゲノム）の全塩基配列を取得した。縄文人のミトコンドリアゲノムはすべてハプログループN9bに属していたが、同一の配列はなかった。縄文人を代表するハプログループとして記述されているハプログループN9bに属する縄文人遺体の中でも、高い遺伝的多様性が明らかになった。

Ancient human remains have been assigned to their mitochondrial DNA (mtDNA) haplogroups. To obtain efficiently deep and reliable nucleotide sequences of ancient DNA of interest, we achieved target enrichment followed by next-generation sequencing (NGS). Complete mitochondrial genome (mitogenome) sequences were obtained for three human remains from the Iyai rock-shelter site of the Initial Jomon Period in Japan. All the Jomon mitogenomes belong to haplogroup N9b, but no sequences among them were identical. High genetic diversity was clarified even among the Jomon human remains belonging to haplogroup N9b, which has been described as a haplogroup representing the Jomon people.