多様で豊富なガンマ・デルタコロナウイルスの貯留地としての野鳥

Wild birds as reservoirs for diverse and abundant gamma- and deltacoronaviruses.

• Michelle Wille
• Edward C Holmes

抄録

野鳥は、国や大陸の国境をほとんど無視して毎年移動することで、地球上のあらゆる場所を相互に結びつけている。野生鳥類は、ガンマコロナウイルスやデルタコロナウイルスの多様性が高い宿主であるにもかかわらず、これらのウイルスの生態や進化についてはほとんど理解されていない。このレビューでは、ゲノム配列と生態学的データを用いて、野生鳥類におけるコロナウイルスの進化を解明する。具体的には、ウイルスの属と種のレベルで宿主の範囲を調べ、特定のタイプの鳥類の宿主に偏りがあるにもかかわらず、多くのウイルス種の多宿主性を明らかにした。我々は、サンプリングと技術的な制限のために、ウイルスの生態を推測することは現在のところ困難であると結論づけ、ガンマおよびデルタコロナウイルスの幅の広いアッセイ性能の向上、アッセイの標準化、およびより良いシークエンシングアプローチが、結果の再現性と解釈の両方を改善することを示唆している。最後に、野生の鳥類から哺乳類へのウイルス感染と同様に、野生の鳥類と家禽類との接点における種を超えたウイルス感染についても議論しています。野生鳥類の貯留層における生態と多様性を明らかにすることは、将来、社会経済的に重要な動物種やヒトの集団にコロナウイルスが出現する可能性がある場合に対応する能力に重要な影響を与えるものである。

Wild birds interconnect all parts of the globe through annual cycles of migration with little respect for country or continental borders. Although wild birds are reservoir hosts for a high diversity of gamma- and deltacoronaviruses, we have little understanding of the ecology or evolution of any of these viruses. In this review we use genome sequence and ecological data to disentangle the evolution of coronaviruses in wild birds. Specifically, we explore host range at the levels of viral genus and species, and reveal the multi-host nature of many viral species, albeit with biases to certain types of avian host. We conclude that it is currently challenging to infer viral ecology due to major sampling and technical limitations, and suggest that improved assay performance across the breadth of gamma- and deltacoronaviruses, assay standardization, as well as better sequencing approaches, will improve both the repeatability and interpretation of results. Finally, we discuss cross-species virus transmission across both the wild bird-poultry interface as well as from birds to mammals. Clarifying the ecology and diversity in the wild bird reservoir has important ramifications for our ability to respond to the likely future emergence of coronaviruses in socioeconomically important animal species or human populations.

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