直鎖状シアノペプチドのフラグメンテーションマススペクトルデータセット - マイクロギニン

Fragmentation mass spectra dataset of linear cyanopeptides - microginins.

• Sevasti-Kiriaki Zervou
• Triantafyllos Kaloudis
• Anastasia Hiskia
• Hanna Mazur-Marzec

抄録

マイクロギニンは、シアノバクテリアの生理活性を持つ線状ペプチドの中では、あまり一般的ではないクラスのものです。最近、ギリシャの淡水から採取したシアノバクテリアとその培養株の中にマイクロギニンが存在するかどうかの調査が行われました。今回のデータセットは、研究論文"New microginins from cyanobacteria of Greek freshwaters"に関連するものである[1]。藍藻のバイオマスは、ブルームサンプルと培養株からメタノール水溶液で抽出した。抽出物は、ハイブリッドトリプル四重極/リニアイオントラップ質量分析計(LC-qTRAP MS/MS)と結合した液体クロマトグラフィーを用いて、情報依存性取得(IDA)モードで分析した。イオンフラグメンテーションスペクトルの収集には、エンハンストイオンプロダクト（EIP）モードを適用した。マイクロギニンの同定は、固有のマイクロギニンアミノ酸である3-アミノ-2-ヒドロキシデカン酸(Ahda)とその修飾形態の特徴的なフラグメントイオンに基づいて行った。フラグメンテーションスペクトルの解析により、36の新規変異体を含む51のマイクロギニン構造が明らかになった。本論文では、ギリシャの淡水のシアノバクテリアから検出されたミクロギニンのフラグメンテーションマススペクトルのデータセットを提供する。このクラスのシアノペプチドは、異なる地域のシアノバクテリアによって産生されるため、このデータセットの目的は、今後の研究でマイクロギニンの同定を可能にし、世界中の淡水域におけるマイクロギニンの存在をより良く評価することに貢献することである。

Microginins are the less common class of bioactive linear cyanobacterial peptides. Recently, an investigation for their presence in cyanobacteria from Greek freshwaters and strain cultures was carried out. The present dataset is related to the research article "New microginins from cyanobacteria of Greek freshwaters" [1]. Cyanobacterial biomass from bloom samples and cultured strains were extracted with aqueous methanol. Extracts were analysed by liquid chromatography coupled to hybrid triple quadrupole/linear ion trap mass spectrometer (LC-qTRAP MS/MS) in information dependent acquisition (IDA) mode. Enhanced ion product (EIP) mode was applied for the collection of ion fragmentation spectra. Identification of microginins was based on the characteristic fragment ions of the unique microginin amino acid 3-amino-2-hydroxy-decanoic acid (Ahda) and its modified forms. The analysis of fragmentation spectra revealed 51 microginin structures, including 36 new variants. This article provides the dataset of fragmentation mass spectra of the microginins detected in cyanobacteria from Greek freshwaters. As this class of cyanopeptides is produced by cyanobacteria from different geographical regions, the aim of this dataset is to enable the identification of microginins in future studies and therefore to contribute to a better evaluation of their presence in freshwater bodies worldwide.

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