ゲノムインプリンティング解析により、1型糖尿病と関節リウマチにおける表現型の変動の原因として母親の影響が同定された

Genomic imprinting analyses identify maternal effects as a cause of phenotypic variability in type 1 diabetes and rheumatoid arthritis.

• Inga Blunk
• Hauke Thomsen
• Norbert Reinsch
• Manfred Mayer
• Asta Försti
• Jan Sundquist
• Kristina Sundquist
• Kari Hemminki

抄録

親由来効果（POE）をもたらす転写遺伝子は、1型糖尿病（T1D）や関節リウマチ（RA）に影響を与えると仮説されている。しかし、母親の影響も役割を果たしている可能性がある。すべての種類のPOEを同時に考慮できる混合モデルを用いて、T1DとRAの発症に対するPOEの重要性を分散成分分析で検討した。解析はスウェーデンの人口規模の血統データを用いた。P=0.18（T1D）、P=0.26（RA）で、インプリンティングの分散は有意ではなかった。表現型の分散の19.00％（±2.00％）と15.00％（±6.00％）まで説明できたが、母体環境の分散はT1D（P=1.60×10）とRA（P=0.02）で有意であった。RAに対する母親の遺伝的影響の存在が初めて示され、全分散の16.00％（±3.00％）まで寄与していた。また、社会経済指標、子供の数、出生年、性別との相互作用などの環境因子が大きな影響を与えていた。

Imprinted genes, giving rise to parent-of-origin effects (POEs), have been hypothesised to affect type 1 diabetes (T1D) and rheumatoid arthritis (RA). However, maternal effects may also play a role. By using a mixed model that is able to simultaneously consider all kinds of POEs, the importance of POEs for the development of T1D and RA was investigated in a variance components analysis. The analysis was based on Swedish population-scale pedigree data. With P = 0.18 (T1D) and P = 0.26 (RA) imprinting variances were not significant. Explaining up to 19.00% (± 2.00%) and 15.00% (± 6.00%) of the phenotypic variance, the maternal environmental variance was significant for T1D (P = 1.60 × 10) and for RA (P = 0.02). For the first time, the existence of maternal genetic effects on RA was indicated, contributing up to 16.00% (± 3.00%) of the total variance. Environmental factors such as the social economic index, the number of offspring, birth year as well as their interactions with sex showed large effects.