(Mont.) de Bary.のエフェクター遺伝子における対立遺伝子変異と選択

Allelic Variation and Selection in Effector Genes of (Mont.) de Bary.

• Juan G Morales
• Astrid E Gaviria
• Elizabeth Gilchrist

抄録

は、ジャガイモ（）、トマト（）、ツリートマト（）、ルロ（）、ウチュウバ（）、野生種のsp.属の野生種のようなアンデスの果物などのいくつかの作物の壊滅的な植物病原体である。 世界中で行われた激しい研究にもかかわらず、南米コロンビアからの個体群は十分に理解されていない。特に重要なのは病原体エフェクタータンパク質に関する知識である。本研究では、異なる宿主や地域から採取した単離株のエフェクタータンパク質をコードする遺伝子配列を解析することを目的とした。その結果、非同義置換および同義置換に対する遺伝的パラメータ、系統解析および中立性検定を行った。非同義置換は、DNAレベルで多型を示すすべての遺伝子について同定した。その結果、2つの遺伝子（および）について有意な負の選択値が認められ、対応する宿主抵抗性タンパク質との共進化が活発に行われていることが示唆された。病原体の病原性メカニズムや病気の管理への影響について議論した。

is a devastating plant pathogen in several crops such as potato (), tomato () and Andean fruits such as tree tomato (), lulo (), uchuva () and wild species in the genus sp. Despite intense research performed around the world, populations from Colombia, South America, are poorly understood. Of particular importance is knowledge about pathogen effector proteins, which are responsible for virulence. The present work was performed with the objective to analyze gene sequences coding for effector proteins of from isolates collected from different hosts and geographical regions. Several genetic parameters, phylogenetic analyses and neutrality tests for non-synonymous and synonymous substitutions were calculated. Non-synonymous substitutions were identified for all genes that exhibited polymorphisms at the DNA level. Significant negative selection values were found for two genes ( and ) suggesting active coevolution with the corresponding host resistance proteins. Implications for pathogen virulence mechanisms and disease management are discussed.