アマゾンの河口域で養殖されたマングローブカキ（Crassostrea gasar）から分離された大腸菌株の発生、抗生物質耐性および病原性

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Mar. Pollut. Bull..2020 Aug;157:111302. S0025-326X(20)30420-3. doi: 10.1016/j.marpolbul.2020.111302.Epub 2020-06-01.

アマゾンの河口域で養殖されたマングローブカキ（Crassostrea gasar）から分離された大腸菌株の発生、抗生物質耐性および病原性

Occurrence, antibiotic-resistance and virulence of E. coli strains isolated from mangrove oysters (Crassostrea gasar) farmed in estuaries of Amazonia.

Amanda M S Oliveira
Rafael A Baraúna
Davi J Marcon
Letícia A B Lago
Artur Silva
Joana Lusio
Rafael D S Tavares
Marta Tacão
Isabel Henriques
Maria P C Schneider

PMID: 32658670 DOI: 10.1016/j.marpolbul.2020.111302.

抄録

マングローブカキ（Crassostrea gasar）の腸内に糞便汚染を示す細菌種が集中していることは、公衆衛生と食品監視上の大きな懸念事項である。我々の研究の目的は、アマゾンの4つの河口で養殖されたC. gasarから分離されたEscherichia coli株の発生、抗生物質耐性、系統的プロファイル、および病原性を明らかにすることである。Santo Antônio de Urindeuaは、カキ試料中の大腸菌細胞数が最も多いサンプリング地点であった（試料100gあたり10個）。セファロチンに対する耐性は24株（52.2％）、アモキシシリンに対する耐性は18株（39.1％）であった。18のクローン集団はrep-PCR法により決定され，主に病原性および共生性のフィログループB1およびDに属していた．大部分の株でF不和合性グループのプラスミドが検出された．すべての分離株は最後の砦となる抗生物質に感受性を示した．

Concentration of bacterial species indicative of fecal contamination in the gut of mangrove oysters (Crassostrea gasar) is a major concern for public health and food surveillance. Our work aimed to determine the occurrence, antibiotic-resistance, phylogenetic profile and virulence of Escherichia coli strains isolated from C. gasar farmed in four estuaries of Amazonia. Santo Antônio de Urindeua was the sampling point with the highest number of E. coli cells in oyster samples (10 per 100 g of sample). Twenty-four isolates (52.2%) showed resistance to cephalotin and 18 to amoxicillin (39.1%). Eighteen clonal populations were determined by rep-PCR and were mainly affiliated to the pathogenic and commensal phylo-groups B1 and D. The presence of elt genes suggests that 10 of these clones belong to the Enterotoxigenic Escherichia coli pathotype. Plasmids, mostly of the F incompatibility group, were detected in the majority of the strains. All isolates were susceptible to last-resort antibiotics.