1q21.1における多様で反復的な欠失および重複に関連する疾患

Disorders Associated With Diverse, Recurrent Deletions and Duplications at 1q21.1.

• Hui Pang
• Xiaowei Yu
• Young Mi Kim
• Xianfu Wang
• Jeremy K Jinkins
• Jianing Yin
• Shibo Li
• Hongcang Gu

抄録

染色体下領域1q21.1は、何百ものセグメント重複が存在するため、欠失や相互重複のホットスポットとなっているヒトゲノムの一つである。この領域での欠失や重複の再発は、様々な臨床症状を呈する患者の原因となっていると考えられています。ゲノム上の位置に基づいて、1q21.1遺伝子座における欠失および重複は、染色体1q21.1欠失症候群、染色体1q21.1重複症候群、および近位1q21.1領域における欠失に部分的に起因する血小板減少症-欠失半径(TAR)症候群という区別可能な症候群と関連している。我々は、5,200人のコホートから得た36人の患者において、1q21.1遺伝子座における多様で再発性の欠失および重複を報告している。36人の患者のうち、18人の患者が1q21.1欠失を持ち、9人の患者が1q21.1に重複を持ち、2人の患者が同一の短い欠失を持ち、残りの7人は近位の1q21.1領域に可変サイズの重複を持っていた。さらに、各患者の細胞遺伝学的特徴と詳細な臨床的特徴を明らかにした。特筆すべきは、近位1q21.1領域の重複は、これまでに発表された論文の中で定義された障害とは関連していないことである。しかし、7人の患者の間で近位1q21.1領域の重複が再発していることから、これらの変異体が病原性を持っている可能性が高いことが強く示唆された。これらの障害の共通の表現型の特徴もまた、臨床診断および遺伝カウンセリングを容易にするために要約されている。

The subchromosomal region 1q21.1 is one of the hotspots in the human genome for deletions and reciprocal duplications, owing to the existence of hundreds of segmental duplications. Recurrent deletions and duplications in this region are thought to be causative in patients with variable clinical manifestations. Based on the genomic locations, deletions and duplications at the 1q21.1 locus have been associated with distinguishable syndromes: chromosome 1q21.1 deletion syndrome, chromosome 1q21.1 duplication syndrome, and thrombocytopenia-absent radius (TAR) syndrome, which is partially due to deletions at the proximal 1q21.1 region. We report here diverse, recurrent deletions and duplications at the 1q21.1 locus in 36 patients from a cohort of 5,200 individuals. Among the 36 patients, 18 patients carry 1q21.1 deletions, nine individuals have reciprocal duplications at 1q21.1, two patients share an identical short deletion, and the remaining seven possess variable sizes of duplications at the proximal 1q21.1 region. Furthermore, we provide cytogenetic characterization and detailed clinical features for each patient. Notably, duplications at the proximal 1q21.1 region have not been associated with a defined disorder in publications. However, recurrent duplications at the proximal 1q21.1 region among the seven patients strongly suggested that the variants are likely pathogenic. The common phenotypical features of those disorders are also summarized to facilitate clinical diagnoses and genetic counseling.

Copyright © 2020 Pang, Yu, Kim, Wang, Jinkins, Yin, Li and Gu.