RNA 5-メチルシトシン部位の同定に用いられている計算手法のミニレビュー

A Mini-review of the Computational Methods Used in Identifying RNA 5-Methylcytosine Sites.

• Jianwei Li
• Yan Huang
• Yuan Zhou

抄録

RNA 5-メチルシトシン（mC）は、転写後修飾（PTCM）の柱の一つである。mCがRNAの代謝に重要な役割を果たしていることを示唆する証拠が増えています。組織細胞内のRNA mC部位の正確な局在化は、mCの機能を深く理解するための前提であり、基礎である。しかし、mC部位を検出するための主な実験方法は程度の差こそあれ限られている。改変部位を予測する計算モデルを確立することは、mC部位を同定するための湿式実験を補完する優れた方法である。本レビューでは、いくつかの利用可能なmC予測法をまとめ、これらの手法の特徴を議論した。

RNA 5-methylcytosine (mC) is one of the pillars of post-transcriptional modification (PTCM). A growing body of evidence suggests that mC plays a vital role in RNA metabolism. Accurate localization of RNA mC sites in tissue cells is the premise and basis for the in-depth understanding of the functions of mC. However, the main experimental methods of detecting mC sites are limited to varying degrees. Establishing a computational model to predict modification sites is an excellent complement to wet experiments for identifying mC sites. In this review, we summarized some available mC predictors and discussed the characteristics of these methods.

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