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黒海・トルコ海峡系の短頭コモンドルフィンの個体群遺伝的構造
Population genetic structure of the short-beaked common dolphin from the Black Sea and the Turkish Straits System.
PMID: 32654598 DOI: 10.1080/24701394.2020.1788008.
抄録
本研究では、黒海とトルコ海峡系（TSS）の短頭コモンドルフィンの個体群連結性、進化史、保全状況を評価することを目的としています。また、大西洋と地中海からのDNA配列も含めて、地域的な視点からの研究を行っている。黒海、トルコ海峡、エーゲ海の短角コモンイルカから採取した37サンプルの366塩基対のミトコンドリアDNA Dループ断片を解析したところ、13のハプロタイプが明らかになり、そのうち8つはこれまでに報告されていないものであった。GenBankに保存されているサンプルを解析したところ、この地域全体で89種類のハプロタイプが明らかになった。ハプロタイプネットワークには、すべての場所の個体を含む2つの主要な周辺グループが含まれている。大西洋のハプロタイプはネットワーク全体に散在しており、明らかな集団分離は検出されなかった。いくつかの共有されたハプロタイプは、大西洋東部から地中海への多方向の植民地化現象を示唆する可能性がある。さらに、あまり広く分布していないいくつかのハプロタイプは、ジブラルタル海峡とTSSを介したより最近の遺伝的接続性を示唆しており、短頭種のコモンドルフィンの分散におけるこれらの海峡の重要性を指摘している。ハプロタイプとヌクレオチド多様性の値は、大西洋に比べて黒海、黄海、地中海西部で低く、大西洋の個体群が地中海と黒海に拡大したことを裏付けるものであった。大西洋と地中海、TSSと黒海ではФstに基づく差が見られたが、地中海と黒海では差は見られなかった。高い分散性を持つコモンイルカにとっては、接続性を高めるための外洋と狭い海路の保護が重要であるかもしれない。
Our study aims to assess the population connectivity, evolutionary history, and conservation status of the short-beaked common dolphin in the Black Sea and Turkish Straits System (TSS). We also include DNA sequences from the Atlantic Ocean and the Mediterranean Sea to provide a regional perspective to our localized study. Analysis of 366 base pairs of mitochondrial DNA D-loop fragments from 37 samples collected from short-beaked common dolphins in the Black Sea, TSS, and Aegean Sea revealed 13 haplotypes, eight of which have not been previously reported. While analysis of samples archived on GenBank revealed 89 different haplotypes across the region. The haplotype network contains two main peripheral groups that include individuals from all locations. Haplotypes from the Atlantic Ocean are scattered across the network and no obvious population separation was detected. Some shared haplotypes potentially indicate multi-directional colonization events of the Mediterranean Sea from the eastern Atlantic Ocean. Moreover, some less widely distributed haplotypes suggest some level of more recent genetic connectivity through the Strait of Gibraltar and the TSS and point out the importance of these straits in the dispersal of short-beaked common dolphins. The haplotype and nucleotide diversity values were lower in the Black Sea, TSS, and western Mediterranean Sea when compared to the Atlantic Ocean, supporting the expansion of Atlantic populations into the Mediterranean and the Black Seas. Differentiation was observed between the Atlantic Ocean, and the Mediterranean Sea, TSS and the Black Sea based on Фst but not between Mediterranean and the Black Seas. For common dolphins, which have high dispersal potential, the protection of open seas and narrow seaways to enhance connectivity may be crucial.