結核治療レジメンへの高用量イソニアジドの組み入れをガイドするためのイソニアジド耐性マーカーの同定：システマティックレビュー

/ /

日本語AIでPubMedを検索

PubMedの提供する医学論文データベースを日本語で検索できます。AI(Deep Learning)を活用した機械翻訳エンジンにより、精度高く日本語へ翻訳された論文をご参照いただけます。

Clin. Microbiol. Infect..2020 Jul;S1198-743X(20)30387-6. doi: 10.1016/j.cmi.2020.07.004.Epub 2020-07-09.

結核治療レジメンへの高用量イソニアジドの組み入れをガイドするためのイソニアジド耐性マーカーの同定：システマティックレビュー

Identifying isoniazid resistance markers to guide inclusion of high-dose isoniazid in tuberculosis treatment regimens: a systematic review.

Emmanuel Rivière
Michael G Whitfield
Jochem Nelen
Tim H Heupink
Annelies Van Rie

PMID: 32653663 DOI: 10.1016/j.cmi.2020.07.004.

抄録

背景:

抗生物質の効果的な使用は、世界的な結核のパンデミックを抑制するために非常に重要である。高用量イソニアジド（INH）は低レベルの耐性がある場合に有効である。

BACKGROUND: Effective use of antibiotics is critical to control the global tuberculosis pandemic. High-dose isoniazid (INH) can be effective in the presence of low-level resistance.

目的:

ゲノムマイコバクテリウム・結核（Mtb）バリアントが INH 耐性のレベルに与える影響の違いについての理解を深めるために、系統的な文献レビューを行った。

OBJECTIVES: We performed a systematic literature review to improve our understanding of the differential impact of genomic Mycobacterium tuberculosis (Mtb) variants on the level of INH resistance.

出所:

以下のオンラインデータベースを検索しました。PubMed、Web of Science、Embase。

SOURCES: Following online databases were searched: PubMed, Web of Science and Embase.

参加資格の基準を勉強する:

遺伝子型および表現型データがリンクしており、INH耐性レベルが報告されているMtb臨床分離株について報告している論文は対象とした。

STUDY ELIGIBILITY CRITERIA: Articles reporting on clinical Mtb isolates with linked genotypic and phenotypic data and reporting INH resistance levels were eligible for inclusion.

方法:

対象となる研究で報告されたすべてのゲノム領域を解析に含めた：katG、inhA、ahpC、oxyR-ahpC、furA、fabG1、kasA、rv1592c、iniA、iniB、iniiC、rv0340、rv2242およびnat。INH耐性のレベルは、最小阻害濃度（MIC）によって決定された：低レベルの耐性は、液体上で0.1〜0.4μg/ml、固体媒体上で0.2〜1.0μg/mlと定義され、高レベルの耐性は、液体上で>0.4μg/ml、固体媒体上で>1.0μg/mlと定義された。

METHODS: All genomic regions reported in the eligible studies were included in the analysis, including: katG, inhA, ahpC, oxyR-ahpC, furA, fabG1, kasA, rv1592c, iniA, iniB, iniC, rv0340, rv2242 and nat. The level of INH resistance was determined by minimum inhibitory concentration (MIC): low-level resistance was defined as 0.1-0.4μg/ml on liquid and 0.2-1.0μg/ml on solid media, high-level resistance as >0.4μg/ml on liquid and >1.0μg/ml on solid media.

結果:

121212件の研究記録が検索され，そのうち46件が含まれていた．これら46件の研究では1697株が報告されており，そのうち21％（n=362）がINH感受性，17％（n=287）が低レベルのINH耐性，62％（n=1048）が高レベルのINH耐性を有していた．全体では，分離株の24％（n=402）が野生型と報告され，76％（n=1295）が1以上の関連遺伝子変異を有していた．1以上の変異を持つ1295株のうち，78％（n=1011）がkatG遺伝子に変異を有していた．315コドンにkatG変異を有する867株のうち、93％（n=810）が高レベルのINH耐性を有していた。一方，315位に変異を持たないkatG変異を持つ144株のうち，高レベルの抵抗性を示したのは50％（n=72）のみであった．また，関連遺伝子変異が1以上で野生型のkatG遺伝子を有する284株のうち，40％（n=114）が高レベルのINH耐性を有していた。

RESULTS: 1212 records were retrieved of which 46 were included. These 46 studies reported 1697 isolates of which 21% (n=362) were INH susceptible, 17% (n=287) had low-level, and 62% (n=1048) high-level INH resistance. Overall, 24% (n=402) of isolates were reported as wild type and 76% (n=1295) had ≥1 relevant genetic variant. Among 1295 isolates with ≥1 variant, 78% (n=1011) had a mutation in the katG gene. Of the 867 isolates with a katG mutation in codon 315, 93% (n=810) had high-level INH resistance. In contrast, only 50% (n=72) of the 144 isolates with a katG variant not in the 315-position had high-level resistance. Of the 284 isolates with ≥1 relevant genetic variant and wild type katG gene, 40% (n=114) had high-level INH resistance.

結論:

katG遺伝子の変異体の存在は、コドン315に位置する場合にのみ、高レベルのINH耐性の良好なマーカーとなる。

CONCLUSIONS: Presence of a variant in the katG gene is a good marker of high-level INH resistance only if located in codon 315.